Protein–RNA interactions for Protein: Q52KE7

Ccnl1, Cyclin-L1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccnl1Q52KE7 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccnl1Q52KE7 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccnl1Q52KE7 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccnl1Q52KE7 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccnl1Q52KE7 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccnl1Q52KE7 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccnl1Q52KE7 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccnl1Q52KE7 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccnl1Q52KE7 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccnl1Q52KE7 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccnl1Q52KE7 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccnl1Q52KE7 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccnl1Q52KE7 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccnl1Q52KE7 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccnl1Q52KE7 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccnl1Q52KE7 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccnl1Q52KE7 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccnl1Q52KE7 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccnl1Q52KE7 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccnl1Q52KE7 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccnl1Q52KE7 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccnl1Q52KE7 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccnl1Q52KE7 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccnl1Q52KE7 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccnl1Q52KE7 1700084C06Rik-201ENSMUST00000135674 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccnl1Q52KE7 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccnl1Q52KE7 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccnl1Q52KE7 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccnl1Q52KE7 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccnl1Q52KE7 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccnl1Q52KE7 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccnl1Q52KE7 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccnl1Q52KE7 Gm43947-201ENSMUST00000203019 959 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccnl1Q52KE7 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccnl1Q52KE7 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccnl1Q52KE7 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccnl1Q52KE7 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccnl1Q52KE7 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccnl1Q52KE7 Rpl10a-ps2-201ENSMUST00000071184 642 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccnl1Q52KE7 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccnl1Q52KE7 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccnl1Q52KE7 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccnl1Q52KE7 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccnl1Q52KE7 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccnl1Q52KE7 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccnl1Q52KE7 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccnl1Q52KE7 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccnl1Q52KE7 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccnl1Q52KE7 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccnl1Q52KE7 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccnl1Q52KE7 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccnl1Q52KE7 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccnl1Q52KE7 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccnl1Q52KE7 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccnl1Q52KE7 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccnl1Q52KE7 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccnl1Q52KE7 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccnl1Q52KE7 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccnl1Q52KE7 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccnl1Q52KE7 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccnl1Q52KE7 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccnl1Q52KE7 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccnl1Q52KE7 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccnl1Q52KE7 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccnl1Q52KE7 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccnl1Q52KE7 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccnl1Q52KE7 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccnl1Q52KE7 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccnl1Q52KE7 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccnl1Q52KE7 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccnl1Q52KE7 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccnl1Q52KE7 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccnl1Q52KE7 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccnl1Q52KE7 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccnl1Q52KE7 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccnl1Q52KE7 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccnl1Q52KE7 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccnl1Q52KE7 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccnl1Q52KE7 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccnl1Q52KE7 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccnl1Q52KE7 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccnl1Q52KE7 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccnl1Q52KE7 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccnl1Q52KE7 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccnl1Q52KE7 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccnl1Q52KE7 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccnl1Q52KE7 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccnl1Q52KE7 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccnl1Q52KE7 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccnl1Q52KE7 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccnl1Q52KE7 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccnl1Q52KE7 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccnl1Q52KE7 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccnl1Q52KE7 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccnl1Q52KE7 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccnl1Q52KE7 Gm3625-201ENSMUST00000170816 102 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccnl1Q52KE7 Gm28450-201ENSMUST00000187349 638 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccnl1Q52KE7 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccnl1Q52KE7 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccnl1Q52KE7 Ntan1-201ENSMUST00000023362 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms