Protein–RNA interactions for Protein: Q4U2R1

Herc2, E3 ubiquitin-protein ligase HERC2, mousemouse

Predictions only

Length 4,836 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Herc2Q4U2R1 Gm3685-201ENSMUST00000169215 984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Herc2Q4U2R1 Gm42430-201ENSMUST00000197209 616 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Herc2Q4U2R1 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Herc2Q4U2R1 Gzmk-201ENSMUST00000038212 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Herc2Q4U2R1 Gm10338-201ENSMUST00000096148 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Herc2Q4U2R1 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Herc2Q4U2R1 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Herc2Q4U2R1 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Herc2Q4U2R1 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Herc2Q4U2R1 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Herc2Q4U2R1 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Herc2Q4U2R1 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Herc2Q4U2R1 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Herc2Q4U2R1 4933428M09Rik-201ENSMUST00000113046 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Herc2Q4U2R1 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Herc2Q4U2R1 Gm43184-201ENSMUST00000197247 542 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Herc2Q4U2R1 4930413E15Rik-201ENSMUST00000202500 1290 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Herc2Q4U2R1 AC122346.3-201ENSMUST00000223983 306 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Herc2Q4U2R1 2310057N15Rik-201ENSMUST00000054223 1028 ntAPPRIS P1 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Herc2Q4U2R1 Gm8181-201ENSMUST00000062242 669 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Herc2Q4U2R1 Tmem208-202ENSMUST00000098453 950 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Herc2Q4U2R1 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Herc2Q4U2R1 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Herc2Q4U2R1 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Herc2Q4U2R1 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Herc2Q4U2R1 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Herc2Q4U2R1 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Herc2Q4U2R1 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Herc2Q4U2R1 Mrpl55-202ENSMUST00000108784 729 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Herc2Q4U2R1 Gm11500-201ENSMUST00000118237 601 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Herc2Q4U2R1 Gm13530-201ENSMUST00000134014 390 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Herc2Q4U2R1 Gm24078-201ENSMUST00000158184 103 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Herc2Q4U2R1 CT009536.2-201ENSMUST00000225370 665 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Herc2Q4U2R1 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Herc2Q4U2R1 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Herc2Q4U2R1 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Herc2Q4U2R1 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Herc2Q4U2R1 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Herc2Q4U2R1 Prkaca-202ENSMUST00000211558 1399 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Herc2Q4U2R1 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Herc2Q4U2R1 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Herc2Q4U2R1 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Herc2Q4U2R1 Gm2000-201ENSMUST00000102782 445 ntAPPRIS P1 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Herc2Q4U2R1 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Herc2Q4U2R1 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Herc2Q4U2R1 Gm23400-201ENSMUST00000174994 102 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Herc2Q4U2R1 Gm26463-201ENSMUST00000175065 101 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Herc2Q4U2R1 Gm24332-201ENSMUST00000175102 102 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Herc2Q4U2R1 Gm25959-201ENSMUST00000175112 102 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Herc2Q4U2R1 Gm22475-201ENSMUST00000175169 102 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Herc2Q4U2R1 Gm22903-201ENSMUST00000175193 102 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Herc2Q4U2R1 Gm25070-201ENSMUST00000175237 102 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Herc2Q4U2R1 Gm24159-201ENSMUST00000175264 102 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Herc2Q4U2R1 Gm25299-201ENSMUST00000175283 102 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Herc2Q4U2R1 Gm23798-201ENSMUST00000175560 102 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Herc2Q4U2R1 Gm23802-201ENSMUST00000175565 102 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Herc2Q4U2R1 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Herc2Q4U2R1 Gm25708-201ENSMUST00000177687 102 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Herc2Q4U2R1 Gm24370-201ENSMUST00000178007 102 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Herc2Q4U2R1 Gm23049-201ENSMUST00000178068 102 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Herc2Q4U2R1 Gm28019-201ENSMUST00000178138 101 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Herc2Q4U2R1 Gm25571-201ENSMUST00000178322 102 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Herc2Q4U2R1 Gm25355-201ENSMUST00000178456 101 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Herc2Q4U2R1 Gm24975-201ENSMUST00000178492 101 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Herc2Q4U2R1 Gm23189-201ENSMUST00000178954 102 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Herc2Q4U2R1 Gm25100-201ENSMUST00000179750 101 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Herc2Q4U2R1 Gm23064-201ENSMUST00000179866 101 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Herc2Q4U2R1 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Herc2Q4U2R1 Acy1-208ENSMUST00000214275 1284 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Herc2Q4U2R1 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Herc2Q4U2R1 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Herc2Q4U2R1 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Herc2Q4U2R1 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Herc2Q4U2R1 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Herc2Q4U2R1 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Herc2Q4U2R1 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Herc2Q4U2R1 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Herc2Q4U2R1 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Herc2Q4U2R1 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Herc2Q4U2R1 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Herc2Q4U2R1 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Herc2Q4U2R1 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Herc2Q4U2R1 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Herc2Q4U2R1 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Herc2Q4U2R1 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Herc2Q4U2R1 Mocs2-216ENSMUST00000184672 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Herc2Q4U2R1 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Herc2Q4U2R1 Gm25076-201ENSMUST00000104098 132 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Herc2Q4U2R1 Gm23604-201ENSMUST00000104311 132 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Herc2Q4U2R1 Zfp961-203ENSMUST00000132848 781 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Herc2Q4U2R1 Gm45758-201ENSMUST00000212448 1006 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Herc2Q4U2R1 Gm5455-201ENSMUST00000058710 715 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Herc2Q4U2R1 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Herc2Q4U2R1 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Herc2Q4U2R1 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Herc2Q4U2R1 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Herc2Q4U2R1 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Herc2Q4U2R1 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Herc2Q4U2R1 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Herc2Q4U2R1 Pigu-205ENSMUST00000165234 1626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.3 ms