Protein–RNA interactions for Protein: Q3UNB8

Tmem253, Transmembrane protein 253, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem253Q3UNB8 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Tmem253Q3UNB8 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Tmem253Q3UNB8 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Tmem253Q3UNB8 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Tmem253Q3UNB8 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Tmem253Q3UNB8 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Tmem253Q3UNB8 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Tmem253Q3UNB8 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Tmem253Q3UNB8 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Tmem253Q3UNB8 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Tmem253Q3UNB8 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Tmem253Q3UNB8 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Tmem253Q3UNB8 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Tmem253Q3UNB8 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Tmem253Q3UNB8 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Tmem253Q3UNB8 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Tmem253Q3UNB8 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Tmem253Q3UNB8 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Tmem253Q3UNB8 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Tmem253Q3UNB8 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tmem253Q3UNB8 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tmem253Q3UNB8 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tmem253Q3UNB8 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tmem253Q3UNB8 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tmem253Q3UNB8 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Tmem253Q3UNB8 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Tmem253Q3UNB8 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tmem253Q3UNB8 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tmem253Q3UNB8 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tmem253Q3UNB8 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tmem253Q3UNB8 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tmem253Q3UNB8 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tmem253Q3UNB8 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tmem253Q3UNB8 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Tmem253Q3UNB8 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Tmem253Q3UNB8 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tmem253Q3UNB8 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tmem253Q3UNB8 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tmem253Q3UNB8 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tmem253Q3UNB8 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tmem253Q3UNB8 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Tmem253Q3UNB8 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tmem253Q3UNB8 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tmem253Q3UNB8 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Tmem253Q3UNB8 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tmem253Q3UNB8 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tmem253Q3UNB8 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tmem253Q3UNB8 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tmem253Q3UNB8 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tmem253Q3UNB8 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tmem253Q3UNB8 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tmem253Q3UNB8 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tmem253Q3UNB8 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Tmem253Q3UNB8 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tmem253Q3UNB8 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tmem253Q3UNB8 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tmem253Q3UNB8 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tmem253Q3UNB8 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tmem253Q3UNB8 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tmem253Q3UNB8 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tmem253Q3UNB8 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tmem253Q3UNB8 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tmem253Q3UNB8 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tmem253Q3UNB8 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tmem253Q3UNB8 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tmem253Q3UNB8 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tmem253Q3UNB8 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tmem253Q3UNB8 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tmem253Q3UNB8 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tmem253Q3UNB8 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tmem253Q3UNB8 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tmem253Q3UNB8 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tmem253Q3UNB8 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tmem253Q3UNB8 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tmem253Q3UNB8 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tmem253Q3UNB8 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tmem253Q3UNB8 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tmem253Q3UNB8 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tmem253Q3UNB8 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tmem253Q3UNB8 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Tmem253Q3UNB8 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tmem253Q3UNB8 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Tmem253Q3UNB8 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Tmem253Q3UNB8 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tmem253Q3UNB8 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tmem253Q3UNB8 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tmem253Q3UNB8 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tmem253Q3UNB8 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tmem253Q3UNB8 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tmem253Q3UNB8 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tmem253Q3UNB8 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tmem253Q3UNB8 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tmem253Q3UNB8 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tmem253Q3UNB8 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tmem253Q3UNB8 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Tmem253Q3UNB8 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tmem253Q3UNB8 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tmem253Q3UNB8 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tmem253Q3UNB8 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tmem253Q3UNB8 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms