Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMU9

Hdgfl2, Hepatoma-derived growth factor-related protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 669 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdgfl2Q3UMU9 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Hdgfl2Q3UMU9 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Hdgfl2Q3UMU9 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Hdgfl2Q3UMU9 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Hdgfl2Q3UMU9 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Hdgfl2Q3UMU9 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Hdgfl2Q3UMU9 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Hdgfl2Q3UMU9 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Hdgfl2Q3UMU9 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Hdgfl2Q3UMU9 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Hdgfl2Q3UMU9 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Hdgfl2Q3UMU9 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Hdgfl2Q3UMU9 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Hdgfl2Q3UMU9 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hdgfl2Q3UMU9 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hdgfl2Q3UMU9 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hdgfl2Q3UMU9 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hdgfl2Q3UMU9 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hdgfl2Q3UMU9 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hdgfl2Q3UMU9 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hdgfl2Q3UMU9 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hdgfl2Q3UMU9 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hdgfl2Q3UMU9 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hdgfl2Q3UMU9 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hdgfl2Q3UMU9 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hdgfl2Q3UMU9 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hdgfl2Q3UMU9 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hdgfl2Q3UMU9 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hdgfl2Q3UMU9 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hdgfl2Q3UMU9 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hdgfl2Q3UMU9 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hdgfl2Q3UMU9 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hdgfl2Q3UMU9 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hdgfl2Q3UMU9 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hdgfl2Q3UMU9 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hdgfl2Q3UMU9 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Hdgfl2Q3UMU9 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hdgfl2Q3UMU9 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hdgfl2Q3UMU9 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hdgfl2Q3UMU9 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hdgfl2Q3UMU9 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hdgfl2Q3UMU9 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hdgfl2Q3UMU9 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hdgfl2Q3UMU9 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Hdgfl2Q3UMU9 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hdgfl2Q3UMU9 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hdgfl2Q3UMU9 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hdgfl2Q3UMU9 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hdgfl2Q3UMU9 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hdgfl2Q3UMU9 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hdgfl2Q3UMU9 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hdgfl2Q3UMU9 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Hdgfl2Q3UMU9 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hdgfl2Q3UMU9 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hdgfl2Q3UMU9 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hdgfl2Q3UMU9 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Hdgfl2Q3UMU9 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hdgfl2Q3UMU9 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hdgfl2Q3UMU9 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hdgfl2Q3UMU9 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hdgfl2Q3UMU9 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hdgfl2Q3UMU9 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hdgfl2Q3UMU9 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hdgfl2Q3UMU9 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hdgfl2Q3UMU9 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hdgfl2Q3UMU9 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hdgfl2Q3UMU9 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hdgfl2Q3UMU9 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hdgfl2Q3UMU9 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Hdgfl2Q3UMU9 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Hdgfl2Q3UMU9 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Hdgfl2Q3UMU9 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hdgfl2Q3UMU9 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Hdgfl2Q3UMU9 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hdgfl2Q3UMU9 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hdgfl2Q3UMU9 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hdgfl2Q3UMU9 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hdgfl2Q3UMU9 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hdgfl2Q3UMU9 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hdgfl2Q3UMU9 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hdgfl2Q3UMU9 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hdgfl2Q3UMU9 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hdgfl2Q3UMU9 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hdgfl2Q3UMU9 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hdgfl2Q3UMU9 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Hdgfl2Q3UMU9 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Hdgfl2Q3UMU9 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hdgfl2Q3UMU9 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hdgfl2Q3UMU9 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hdgfl2Q3UMU9 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hdgfl2Q3UMU9 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Hdgfl2Q3UMU9 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hdgfl2Q3UMU9 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hdgfl2Q3UMU9 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hdgfl2Q3UMU9 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hdgfl2Q3UMU9 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hdgfl2Q3UMU9 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hdgfl2Q3UMU9 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hdgfl2Q3UMU9 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hdgfl2Q3UMU9 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms