Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJP5

Protein C8orf37 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3UJP5 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Q3UJP5 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Q3UJP5 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Q3UJP5 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Q3UJP5 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q3UJP5 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q3UJP5 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q3UJP5 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q3UJP5 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q3UJP5 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q3UJP5 Gm42817-201ENSMUST00000198962 607 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q3UJP5 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q3UJP5 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Q3UJP5 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q3UJP5 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q3UJP5 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q3UJP5 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q3UJP5 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q3UJP5 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q3UJP5 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q3UJP5 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q3UJP5 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q3UJP5 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q3UJP5 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q3UJP5 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q3UJP5 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q3UJP5 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Q3UJP5 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q3UJP5 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q3UJP5 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q3UJP5 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Q3UJP5 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q3UJP5 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q3UJP5 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q3UJP5 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q3UJP5 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q3UJP5 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q3UJP5 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q3UJP5 Prdx1-202ENSMUST00000106470 877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q3UJP5 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q3UJP5 Hmgn1-202ENSMUST00000133885 261 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q3UJP5 Gm11290-203ENSMUST00000147811 314 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q3UJP5 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Q3UJP5 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q3UJP5 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q3UJP5 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q3UJP5 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q3UJP5 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q3UJP5 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q3UJP5 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q3UJP5 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q3UJP5 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q3UJP5 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Q3UJP5 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q3UJP5 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q3UJP5 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q3UJP5 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q3UJP5 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q3UJP5 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q3UJP5 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q3UJP5 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q3UJP5 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q3UJP5 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q3UJP5 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q3UJP5 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q3UJP5 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q3UJP5 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q3UJP5 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q3UJP5 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q3UJP5 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q3UJP5 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q3UJP5 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q3UJP5 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q3UJP5 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q3UJP5 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q3UJP5 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q3UJP5 Gm13611-201ENSMUST00000118269 318 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Q3UJP5 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Q3UJP5 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q3UJP5 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q3UJP5 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q3UJP5 1110002L01Rik-203ENSMUST00000179637 586 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q3UJP5 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Q3UJP5 Gm3508-201ENSMUST00000186012 792 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Q3UJP5 AC141438.2-201ENSMUST00000215068 271 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Q3UJP5 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Q3UJP5 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Q3UJP5 AC135114.1-201ENSMUST00000228682 270 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Q3UJP5 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q3UJP5 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q3UJP5 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q3UJP5 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q3UJP5 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q3UJP5 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q3UJP5 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q3UJP5 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q3UJP5 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q3UJP5 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q3UJP5 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q3UJP5 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.8 ms