Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJB9

Edc4, Enhancer of mRNA-decapping protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Edc4Q3UJB9 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Edc4Q3UJB9 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Edc4Q3UJB9 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Edc4Q3UJB9 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Edc4Q3UJB9 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Edc4Q3UJB9 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Edc4Q3UJB9 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Edc4Q3UJB9 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Edc4Q3UJB9 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Edc4Q3UJB9 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Edc4Q3UJB9 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Edc4Q3UJB9 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Edc4Q3UJB9 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Edc4Q3UJB9 Rpl28-ps3-201ENSMUST00000116058 393 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Edc4Q3UJB9 Gm12217-201ENSMUST00000118858 696 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Edc4Q3UJB9 Anapc16-202ENSMUST00000182116 581 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Edc4Q3UJB9 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Edc4Q3UJB9 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Edc4Q3UJB9 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Edc4Q3UJB9 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Edc4Q3UJB9 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Edc4Q3UJB9 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Edc4Q3UJB9 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Edc4Q3UJB9 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Edc4Q3UJB9 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Edc4Q3UJB9 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Edc4Q3UJB9 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Edc4Q3UJB9 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Edc4Q3UJB9 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Edc4Q3UJB9 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Edc4Q3UJB9 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Edc4Q3UJB9 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Edc4Q3UJB9 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Edc4Q3UJB9 Gsdma2-201ENSMUST00000017355 1314 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Edc4Q3UJB9 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Edc4Q3UJB9 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Edc4Q3UJB9 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Edc4Q3UJB9 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Edc4Q3UJB9 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Edc4Q3UJB9 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Edc4Q3UJB9 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Edc4Q3UJB9 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Edc4Q3UJB9 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Edc4Q3UJB9 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Edc4Q3UJB9 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Edc4Q3UJB9 Gm18753-201ENSMUST00000201000 566 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Edc4Q3UJB9 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Edc4Q3UJB9 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Edc4Q3UJB9 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Edc4Q3UJB9 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Edc4Q3UJB9 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Edc4Q3UJB9 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Edc4Q3UJB9 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Edc4Q3UJB9 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Edc4Q3UJB9 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Edc4Q3UJB9 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Edc4Q3UJB9 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Edc4Q3UJB9 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Edc4Q3UJB9 Gm43289-201ENSMUST00000200537 1475 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Edc4Q3UJB9 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Edc4Q3UJB9 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Edc4Q3UJB9 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Edc4Q3UJB9 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Edc4Q3UJB9 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Edc4Q3UJB9 Gm23200-201ENSMUST00000104379 132 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Edc4Q3UJB9 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Edc4Q3UJB9 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Edc4Q3UJB9 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Edc4Q3UJB9 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Edc4Q3UJB9 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Edc4Q3UJB9 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Edc4Q3UJB9 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Edc4Q3UJB9 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Edc4Q3UJB9 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Edc4Q3UJB9 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Edc4Q3UJB9 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Edc4Q3UJB9 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Edc4Q3UJB9 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Edc4Q3UJB9 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Edc4Q3UJB9 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Edc4Q3UJB9 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Edc4Q3UJB9 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Edc4Q3UJB9 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Edc4Q3UJB9 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Edc4Q3UJB9 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Edc4Q3UJB9 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Edc4Q3UJB9 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Edc4Q3UJB9 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Edc4Q3UJB9 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Edc4Q3UJB9 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Edc4Q3UJB9 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Edc4Q3UJB9 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Edc4Q3UJB9 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Edc4Q3UJB9 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Edc4Q3UJB9 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Edc4Q3UJB9 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Edc4Q3UJB9 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Edc4Q3UJB9 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Edc4Q3UJB9 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Edc4Q3UJB9 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.5 ms