Protein–RNA interactions for Protein: Q3U898

Cops9, COP9 signalosome complex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 57 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops9Q3U898 Nol6-201ENSMUST00000030138 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Cops9Q3U898 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Cops9Q3U898 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Cops9Q3U898 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Cops9Q3U898 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Cops9Q3U898 Lamb1-201ENSMUST00000002979 5784 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Cops9Q3U898 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Cops9Q3U898 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Cops9Q3U898 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Cops9Q3U898 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Cops9Q3U898 Pbrm1-208ENSMUST00000112098 6566 ntTSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Cops9Q3U898 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Cops9Q3U898 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Cops9Q3U898 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Cops9Q3U898 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Cops9Q3U898 Tln2-205ENSMUST00000215267 4999 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Cops9Q3U898 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Cops9Q3U898 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Cops9Q3U898 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Cops9Q3U898 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Cops9Q3U898 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Cops9Q3U898 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Cops9Q3U898 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC9□□□□□ -0.97
Cops9Q3U898 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
Cops9Q3U898 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
Cops9Q3U898 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Cops9Q3U898 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Cops9Q3U898 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Cops9Q3U898 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Cops9Q3U898 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Cops9Q3U898 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Cops9Q3U898 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Cops9Q3U898 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Cops9Q3U898 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Cops9Q3U898 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Cops9Q3U898 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Cops9Q3U898 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Cops9Q3U898 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Cops9Q3U898 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Cops9Q3U898 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Cops9Q3U898 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Cops9Q3U898 Prag1-201ENSMUST00000110492 4780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Cops9Q3U898 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Cops9Q3U898 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Cops9Q3U898 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Cops9Q3U898 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Cops9Q3U898 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Cops9Q3U898 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Cops9Q3U898 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Cops9Q3U898 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Cops9Q3U898 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Cops9Q3U898 Ar-201ENSMUST00000052837 10048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Cops9Q3U898 Zmynd8-205ENSMUST00000109266 5072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Cops9Q3U898 Zmynd8-221ENSMUST00000177633 5093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Cops9Q3U898 Nup50-201ENSMUST00000165443 4741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Cops9Q3U898 Rad51b-202ENSMUST00000171210 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Cops9Q3U898 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Cops9Q3U898 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Cops9Q3U898 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Cops9Q3U898 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Cops9Q3U898 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Cops9Q3U898 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Cops9Q3U898 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Cops9Q3U898 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Cops9Q3U898 Pdik1l-203ENSMUST00000105877 4674 ntTSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Cops9Q3U898 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
Cops9Q3U898 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Cops9Q3U898 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Cops9Q3U898 Fbxl18-202ENSMUST00000110766 7857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Cops9Q3U898 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Cops9Q3U898 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Cops9Q3U898 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Cops9Q3U898 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Cops9Q3U898 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Cops9Q3U898 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Cops9Q3U898 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Cops9Q3U898 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Cops9Q3U898 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Cops9Q3U898 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Cops9Q3U898 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Cops9Q3U898 Maml2-202ENSMUST00000159294 6404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Cops9Q3U898 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Cops9Q3U898 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Cops9Q3U898 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Cops9Q3U898 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Cops9Q3U898 Ankrd26-201ENSMUST00000112830 6930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Cops9Q3U898 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Cops9Q3U898 Mthfsd-201ENSMUST00000047282 8312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Cops9Q3U898 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Cops9Q3U898 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Cops9Q3U898 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Cops9Q3U898 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Cops9Q3U898 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
Cops9Q3U898 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Cops9Q3U898 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Cops9Q3U898 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
Cops9Q3U898 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Cops9Q3U898 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Cops9Q3U898 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
Cops9Q3U898 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms