Protein–RNA interactions for Protein: Q3U4B1

Ssbp4, Single stranded DNA binding protein 4, isoform CRA_b, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssbp4Q3U4B1 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ssbp4Q3U4B1 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ssbp4Q3U4B1 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ssbp4Q3U4B1 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ssbp4Q3U4B1 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ssbp4Q3U4B1 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ssbp4Q3U4B1 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ssbp4Q3U4B1 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ssbp4Q3U4B1 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ssbp4Q3U4B1 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ssbp4Q3U4B1 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ssbp4Q3U4B1 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ssbp4Q3U4B1 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ssbp4Q3U4B1 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ssbp4Q3U4B1 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ssbp4Q3U4B1 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ssbp4Q3U4B1 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ssbp4Q3U4B1 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ssbp4Q3U4B1 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ssbp4Q3U4B1 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ssbp4Q3U4B1 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ssbp4Q3U4B1 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ssbp4Q3U4B1 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ssbp4Q3U4B1 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ssbp4Q3U4B1 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ssbp4Q3U4B1 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Ssbp4Q3U4B1 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Ssbp4Q3U4B1 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ssbp4Q3U4B1 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ssbp4Q3U4B1 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ssbp4Q3U4B1 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ssbp4Q3U4B1 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ssbp4Q3U4B1 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ssbp4Q3U4B1 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ssbp4Q3U4B1 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ssbp4Q3U4B1 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Ssbp4Q3U4B1 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ssbp4Q3U4B1 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ssbp4Q3U4B1 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ssbp4Q3U4B1 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ssbp4Q3U4B1 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ssbp4Q3U4B1 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ssbp4Q3U4B1 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ssbp4Q3U4B1 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ssbp4Q3U4B1 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Ssbp4Q3U4B1 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ssbp4Q3U4B1 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Ssbp4Q3U4B1 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ssbp4Q3U4B1 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ssbp4Q3U4B1 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Ssbp4Q3U4B1 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ssbp4Q3U4B1 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Ssbp4Q3U4B1 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ssbp4Q3U4B1 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ssbp4Q3U4B1 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ssbp4Q3U4B1 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ssbp4Q3U4B1 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ssbp4Q3U4B1 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ssbp4Q3U4B1 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ssbp4Q3U4B1 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ssbp4Q3U4B1 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ssbp4Q3U4B1 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ssbp4Q3U4B1 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ssbp4Q3U4B1 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ssbp4Q3U4B1 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ssbp4Q3U4B1 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ssbp4Q3U4B1 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.63
Ssbp4Q3U4B1 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ssbp4Q3U4B1 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ssbp4Q3U4B1 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ssbp4Q3U4B1 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ssbp4Q3U4B1 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ssbp4Q3U4B1 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Ssbp4Q3U4B1 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ssbp4Q3U4B1 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ssbp4Q3U4B1 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ssbp4Q3U4B1 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ssbp4Q3U4B1 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ssbp4Q3U4B1 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ssbp4Q3U4B1 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ssbp4Q3U4B1 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ssbp4Q3U4B1 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ssbp4Q3U4B1 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ssbp4Q3U4B1 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Ssbp4Q3U4B1 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ssbp4Q3U4B1 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Ssbp4Q3U4B1 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Ssbp4Q3U4B1 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Ssbp4Q3U4B1 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ssbp4Q3U4B1 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Ssbp4Q3U4B1 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Ssbp4Q3U4B1 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Ssbp4Q3U4B1 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Ssbp4Q3U4B1 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Ssbp4Q3U4B1 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Ssbp4Q3U4B1 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ssbp4Q3U4B1 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ssbp4Q3U4B1 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ssbp4Q3U4B1 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Ssbp4Q3U4B1 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms