Protein–RNA interactions for Protein: Q3U319

Rnf40, E3 ubiquitin-protein ligase BRE1B, mousemouse

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Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Rnf40Q3U319 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rnf40Q3U319 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rnf40Q3U319 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rnf40Q3U319 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rnf40Q3U319 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
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Rnf40Q3U319 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
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Rnf40Q3U319 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rnf40Q3U319 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rnf40Q3U319 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Rnf40Q3U319 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rnf40Q3U319 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Rnf40Q3U319 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rnf40Q3U319 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rnf40Q3U319 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rnf40Q3U319 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rnf40Q3U319 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rnf40Q3U319 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rnf40Q3U319 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rnf40Q3U319 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rnf40Q3U319 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rnf40Q3U319 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rnf40Q3U319 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rnf40Q3U319 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rnf40Q3U319 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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