Protein–RNA interactions for Protein: Q3U155

Ccdc174, Coiled-coil domain-containing protein 174, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc174Q3U155 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc174Q3U155 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc174Q3U155 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc174Q3U155 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc174Q3U155 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc174Q3U155 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc174Q3U155 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc174Q3U155 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc174Q3U155 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc174Q3U155 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc174Q3U155 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc174Q3U155 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc174Q3U155 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc174Q3U155 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc174Q3U155 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc174Q3U155 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc174Q3U155 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc174Q3U155 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc174Q3U155 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc174Q3U155 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc174Q3U155 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc174Q3U155 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc174Q3U155 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc174Q3U155 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc174Q3U155 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc174Q3U155 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc174Q3U155 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc174Q3U155 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc174Q3U155 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc174Q3U155 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc174Q3U155 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc174Q3U155 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc174Q3U155 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc174Q3U155 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc174Q3U155 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc174Q3U155 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc174Q3U155 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc174Q3U155 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc174Q3U155 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc174Q3U155 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc174Q3U155 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc174Q3U155 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc174Q3U155 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc174Q3U155 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc174Q3U155 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc174Q3U155 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc174Q3U155 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc174Q3U155 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc174Q3U155 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc174Q3U155 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc174Q3U155 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc174Q3U155 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc174Q3U155 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc174Q3U155 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc174Q3U155 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc174Q3U155 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc174Q3U155 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc174Q3U155 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc174Q3U155 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc174Q3U155 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc174Q3U155 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc174Q3U155 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc174Q3U155 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc174Q3U155 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc174Q3U155 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc174Q3U155 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc174Q3U155 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc174Q3U155 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc174Q3U155 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc174Q3U155 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc174Q3U155 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc174Q3U155 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc174Q3U155 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc174Q3U155 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc174Q3U155 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc174Q3U155 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc174Q3U155 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc174Q3U155 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc174Q3U155 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc174Q3U155 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc174Q3U155 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc174Q3U155 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc174Q3U155 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc174Q3U155 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc174Q3U155 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc174Q3U155 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc174Q3U155 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc174Q3U155 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc174Q3U155 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc174Q3U155 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc174Q3U155 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc174Q3U155 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc174Q3U155 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc174Q3U155 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc174Q3U155 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc174Q3U155 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc174Q3U155 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc174Q3U155 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc174Q3U155 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc174Q3U155 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.5 ms