Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0J8

Tbc1d2b, TBC1 domain family member 2B, mousemouse

Predictions only

Length 965 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tbc1d2bQ3U0J8 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
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Tbc1d2bQ3U0J8 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tbc1d2bQ3U0J8 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tbc1d2bQ3U0J8 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tbc1d2bQ3U0J8 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tbc1d2bQ3U0J8 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tbc1d2bQ3U0J8 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tbc1d2bQ3U0J8 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tbc1d2bQ3U0J8 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tbc1d2bQ3U0J8 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Tbc1d2bQ3U0J8 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
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Tbc1d2bQ3U0J8 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tbc1d2bQ3U0J8 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Tbc1d2bQ3U0J8 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tbc1d2bQ3U0J8 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
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Tbc1d2bQ3U0J8 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
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Tbc1d2bQ3U0J8 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
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Tbc1d2bQ3U0J8 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tbc1d2bQ3U0J8 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tbc1d2bQ3U0J8 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tbc1d2bQ3U0J8 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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Tbc1d2bQ3U0J8 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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Tbc1d2bQ3U0J8 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tbc1d2bQ3U0J8 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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Tbc1d2bQ3U0J8 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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Tbc1d2bQ3U0J8 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tbc1d2bQ3U0J8 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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Tbc1d2bQ3U0J8 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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Tbc1d2bQ3U0J8 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tbc1d2bQ3U0J8 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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Tbc1d2bQ3U0J8 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tbc1d2bQ3U0J8 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tbc1d2bQ3U0J8 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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Tbc1d2bQ3U0J8 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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Tbc1d2bQ3U0J8 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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Tbc1d2bQ3U0J8 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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