Protein–RNA interactions for Protein: Q3TWW8

Srsf6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf6Q3TWW8 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Srsf6Q3TWW8 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Srsf6Q3TWW8 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Srsf6Q3TWW8 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Srsf6Q3TWW8 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Srsf6Q3TWW8 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Srsf6Q3TWW8 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Srsf6Q3TWW8 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Srsf6Q3TWW8 Ndufs5-203ENSMUST00000106207 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Srsf6Q3TWW8 Ccl27a-203ENSMUST00000108033 428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Srsf6Q3TWW8 Gm16036-201ENSMUST00000150385 1112 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Srsf6Q3TWW8 1110002L01Rik-203ENSMUST00000179637 586 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Srsf6Q3TWW8 Gm3508-201ENSMUST00000186012 792 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Srsf6Q3TWW8 Gm10109-202ENSMUST00000206890 1211 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Srsf6Q3TWW8 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Srsf6Q3TWW8 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Srsf6Q3TWW8 Ndufs5-201ENSMUST00000030401 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Srsf6Q3TWW8 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Srsf6Q3TWW8 Il17c-201ENSMUST00000050963 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Srsf6Q3TWW8 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Srsf6Q3TWW8 Gm10109-201ENSMUST00000072123 1078 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Srsf6Q3TWW8 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Srsf6Q3TWW8 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Srsf6Q3TWW8 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Srsf6Q3TWW8 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Srsf6Q3TWW8 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Srsf6Q3TWW8 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Srsf6Q3TWW8 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Srsf6Q3TWW8 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Srsf6Q3TWW8 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Srsf6Q3TWW8 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Srsf6Q3TWW8 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Srsf6Q3TWW8 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Srsf6Q3TWW8 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Srsf6Q3TWW8 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Srsf6Q3TWW8 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Srsf6Q3TWW8 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Srsf6Q3TWW8 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Srsf6Q3TWW8 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Srsf6Q3TWW8 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Srsf6Q3TWW8 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Srsf6Q3TWW8 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Srsf6Q3TWW8 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Srsf6Q3TWW8 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Srsf6Q3TWW8 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Srsf6Q3TWW8 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Srsf6Q3TWW8 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Srsf6Q3TWW8 Hmgn1-202ENSMUST00000133885 261 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Srsf6Q3TWW8 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Srsf6Q3TWW8 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Srsf6Q3TWW8 Gm27552-201ENSMUST00000183351 62 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Srsf6Q3TWW8 Gm27844-201ENSMUST00000183613 62 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Srsf6Q3TWW8 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Srsf6Q3TWW8 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Srsf6Q3TWW8 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Srsf6Q3TWW8 Gm45770-201ENSMUST00000212105 616 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Srsf6Q3TWW8 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Srsf6Q3TWW8 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Srsf6Q3TWW8 Cryab-201ENSMUST00000034562 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Srsf6Q3TWW8 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Srsf6Q3TWW8 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Srsf6Q3TWW8 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Srsf6Q3TWW8 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Srsf6Q3TWW8 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Srsf6Q3TWW8 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Srsf6Q3TWW8 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Srsf6Q3TWW8 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Srsf6Q3TWW8 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Srsf6Q3TWW8 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Srsf6Q3TWW8 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Srsf6Q3TWW8 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Srsf6Q3TWW8 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Srsf6Q3TWW8 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Srsf6Q3TWW8 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Srsf6Q3TWW8 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Srsf6Q3TWW8 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Srsf6Q3TWW8 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Srsf6Q3TWW8 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Srsf6Q3TWW8 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Srsf6Q3TWW8 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Srsf6Q3TWW8 Taf6l-202ENSMUST00000010249 848 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Srsf6Q3TWW8 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Srsf6Q3TWW8 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Srsf6Q3TWW8 Gm8566-201ENSMUST00000120174 465 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Srsf6Q3TWW8 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Srsf6Q3TWW8 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Srsf6Q3TWW8 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Srsf6Q3TWW8 Gm27438-201ENSMUST00000183480 110 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Srsf6Q3TWW8 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Srsf6Q3TWW8 Gm37835-201ENSMUST00000193305 361 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Srsf6Q3TWW8 Gm9555-201ENSMUST00000200908 583 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Srsf6Q3TWW8 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Srsf6Q3TWW8 Gm44126-201ENSMUST00000204831 514 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Srsf6Q3TWW8 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Srsf6Q3TWW8 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Srsf6Q3TWW8 Cd7-201ENSMUST00000026159 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Srsf6Q3TWW8 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Srsf6Q3TWW8 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Srsf6Q3TWW8 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Srsf6Q3TWW8 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms