Protein–RNA interactions for Protein: Q3SYJ2

Prr27, 4930432K09Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr27Q3SYJ2 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Prr27Q3SYJ2 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Prr27Q3SYJ2 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Prr27Q3SYJ2 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Prr27Q3SYJ2 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Prr27Q3SYJ2 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Prr27Q3SYJ2 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Prr27Q3SYJ2 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Prr27Q3SYJ2 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Prr27Q3SYJ2 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Prr27Q3SYJ2 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Prr27Q3SYJ2 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Prr27Q3SYJ2 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Prr27Q3SYJ2 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Prr27Q3SYJ2 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Prr27Q3SYJ2 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Prr27Q3SYJ2 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Prr27Q3SYJ2 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Prr27Q3SYJ2 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Prr27Q3SYJ2 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Prr27Q3SYJ2 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Prr27Q3SYJ2 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Prr27Q3SYJ2 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Prr27Q3SYJ2 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Prr27Q3SYJ2 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Prr27Q3SYJ2 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Prr27Q3SYJ2 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Prr27Q3SYJ2 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Prr27Q3SYJ2 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Prr27Q3SYJ2 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Prr27Q3SYJ2 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Prr27Q3SYJ2 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Prr27Q3SYJ2 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Prr27Q3SYJ2 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Prr27Q3SYJ2 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Prr27Q3SYJ2 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Prr27Q3SYJ2 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Prr27Q3SYJ2 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Prr27Q3SYJ2 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Prr27Q3SYJ2 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Prr27Q3SYJ2 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Prr27Q3SYJ2 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Prr27Q3SYJ2 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Prr27Q3SYJ2 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Prr27Q3SYJ2 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Prr27Q3SYJ2 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Prr27Q3SYJ2 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Prr27Q3SYJ2 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Prr27Q3SYJ2 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Prr27Q3SYJ2 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Prr27Q3SYJ2 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Prr27Q3SYJ2 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.55
Prr27Q3SYJ2 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.55
Prr27Q3SYJ2 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Prr27Q3SYJ2 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Prr27Q3SYJ2 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Prr27Q3SYJ2 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Prr27Q3SYJ2 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Prr27Q3SYJ2 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Prr27Q3SYJ2 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Prr27Q3SYJ2 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Prr27Q3SYJ2 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Prr27Q3SYJ2 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Prr27Q3SYJ2 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Prr27Q3SYJ2 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Prr27Q3SYJ2 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Prr27Q3SYJ2 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Prr27Q3SYJ2 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Prr27Q3SYJ2 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Prr27Q3SYJ2 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Prr27Q3SYJ2 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Prr27Q3SYJ2 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Prr27Q3SYJ2 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Prr27Q3SYJ2 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Prr27Q3SYJ2 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Prr27Q3SYJ2 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Prr27Q3SYJ2 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Prr27Q3SYJ2 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Prr27Q3SYJ2 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Prr27Q3SYJ2 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Prr27Q3SYJ2 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Prr27Q3SYJ2 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Prr27Q3SYJ2 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Prr27Q3SYJ2 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Prr27Q3SYJ2 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Prr27Q3SYJ2 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Prr27Q3SYJ2 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Prr27Q3SYJ2 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Prr27Q3SYJ2 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Prr27Q3SYJ2 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Prr27Q3SYJ2 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Prr27Q3SYJ2 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Prr27Q3SYJ2 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Prr27Q3SYJ2 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Prr27Q3SYJ2 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Prr27Q3SYJ2 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Prr27Q3SYJ2 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Prr27Q3SYJ2 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Prr27Q3SYJ2 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Prr27Q3SYJ2 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms