Protein–RNA interactions for Protein: Q24JP3

Fam178b, Protein FAM178B, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam178bQ24JP3 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fam178bQ24JP3 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Fam178bQ24JP3 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Fam178bQ24JP3 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fam178bQ24JP3 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Fam178bQ24JP3 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Fam178bQ24JP3 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Fam178bQ24JP3 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fam178bQ24JP3 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fam178bQ24JP3 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fam178bQ24JP3 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fam178bQ24JP3 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fam178bQ24JP3 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fam178bQ24JP3 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fam178bQ24JP3 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fam178bQ24JP3 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fam178bQ24JP3 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fam178bQ24JP3 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fam178bQ24JP3 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fam178bQ24JP3 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fam178bQ24JP3 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fam178bQ24JP3 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fam178bQ24JP3 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fam178bQ24JP3 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fam178bQ24JP3 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fam178bQ24JP3 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fam178bQ24JP3 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fam178bQ24JP3 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fam178bQ24JP3 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fam178bQ24JP3 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Fam178bQ24JP3 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Fam178bQ24JP3 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fam178bQ24JP3 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Fam178bQ24JP3 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fam178bQ24JP3 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Fam178bQ24JP3 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Fam178bQ24JP3 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Fam178bQ24JP3 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Fam178bQ24JP3 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fam178bQ24JP3 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Fam178bQ24JP3 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fam178bQ24JP3 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Fam178bQ24JP3 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fam178bQ24JP3 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fam178bQ24JP3 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fam178bQ24JP3 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fam178bQ24JP3 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Fam178bQ24JP3 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Fam178bQ24JP3 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Fam178bQ24JP3 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Fam178bQ24JP3 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Fam178bQ24JP3 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Fam178bQ24JP3 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Fam178bQ24JP3 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Fam178bQ24JP3 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Fam178bQ24JP3 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Fam178bQ24JP3 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Fam178bQ24JP3 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Fam178bQ24JP3 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fam178bQ24JP3 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fam178bQ24JP3 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fam178bQ24JP3 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fam178bQ24JP3 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fam178bQ24JP3 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fam178bQ24JP3 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Fam178bQ24JP3 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fam178bQ24JP3 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fam178bQ24JP3 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fam178bQ24JP3 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fam178bQ24JP3 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fam178bQ24JP3 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fam178bQ24JP3 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fam178bQ24JP3 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fam178bQ24JP3 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Fam178bQ24JP3 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fam178bQ24JP3 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fam178bQ24JP3 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fam178bQ24JP3 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fam178bQ24JP3 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Fam178bQ24JP3 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Fam178bQ24JP3 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Fam178bQ24JP3 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Fam178bQ24JP3 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fam178bQ24JP3 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fam178bQ24JP3 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fam178bQ24JP3 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fam178bQ24JP3 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Fam178bQ24JP3 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fam178bQ24JP3 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fam178bQ24JP3 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fam178bQ24JP3 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fam178bQ24JP3 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fam178bQ24JP3 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fam178bQ24JP3 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fam178bQ24JP3 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fam178bQ24JP3 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fam178bQ24JP3 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fam178bQ24JP3 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fam178bQ24JP3 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fam178bQ24JP3 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.4 ms