Protein–RNA interactions for Protein: Q1RNF8

Samd11, Sterile alpha motif domain-containing protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 542 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd11Q1RNF8 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Samd11Q1RNF8 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Samd11Q1RNF8 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Samd11Q1RNF8 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Samd11Q1RNF8 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Samd11Q1RNF8 Rpsa-ps12-201ENSMUST00000120596 892 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Samd11Q1RNF8 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Samd11Q1RNF8 Gm8546-201ENSMUST00000178288 1264 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Samd11Q1RNF8 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Samd11Q1RNF8 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Samd11Q1RNF8 Gm3508-201ENSMUST00000186012 792 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Samd11Q1RNF8 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Samd11Q1RNF8 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Samd11Q1RNF8 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Samd11Q1RNF8 C230062I16Rik-204ENSMUST00000208342 643 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Samd11Q1RNF8 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Samd11Q1RNF8 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Samd11Q1RNF8 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Samd11Q1RNF8 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Samd11Q1RNF8 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Samd11Q1RNF8 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Samd11Q1RNF8 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Samd11Q1RNF8 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Samd11Q1RNF8 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Samd11Q1RNF8 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Samd11Q1RNF8 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Samd11Q1RNF8 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Samd11Q1RNF8 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Samd11Q1RNF8 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Samd11Q1RNF8 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Samd11Q1RNF8 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Samd11Q1RNF8 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Samd11Q1RNF8 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Samd11Q1RNF8 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Samd11Q1RNF8 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Samd11Q1RNF8 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Samd11Q1RNF8 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Samd11Q1RNF8 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Samd11Q1RNF8 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Samd11Q1RNF8 Abhd14b-210ENSMUST00000217496 631 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Samd11Q1RNF8 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Samd11Q1RNF8 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Samd11Q1RNF8 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Samd11Q1RNF8 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Samd11Q1RNF8 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Samd11Q1RNF8 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Samd11Q1RNF8 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Samd11Q1RNF8 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Samd11Q1RNF8 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Samd11Q1RNF8 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Samd11Q1RNF8 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Samd11Q1RNF8 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Samd11Q1RNF8 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Samd11Q1RNF8 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Samd11Q1RNF8 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Samd11Q1RNF8 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Samd11Q1RNF8 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Samd11Q1RNF8 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Samd11Q1RNF8 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Samd11Q1RNF8 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Samd11Q1RNF8 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Samd11Q1RNF8 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Samd11Q1RNF8 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Samd11Q1RNF8 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Samd11Q1RNF8 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Samd11Q1RNF8 Gm11290-203ENSMUST00000147811 314 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Samd11Q1RNF8 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Samd11Q1RNF8 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Samd11Q1RNF8 Gm37835-201ENSMUST00000193305 361 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Samd11Q1RNF8 Mpzl2-205ENSMUST00000217097 1175 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Samd11Q1RNF8 Hmgb1-202ENSMUST00000093196 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Samd11Q1RNF8 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Samd11Q1RNF8 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Samd11Q1RNF8 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Samd11Q1RNF8 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Samd11Q1RNF8 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Samd11Q1RNF8 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Samd11Q1RNF8 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Samd11Q1RNF8 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Samd11Q1RNF8 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Samd11Q1RNF8 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Samd11Q1RNF8 Det1-202ENSMUST00000107431 1439 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Samd11Q1RNF8 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Samd11Q1RNF8 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Samd11Q1RNF8 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Samd11Q1RNF8 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Samd11Q1RNF8 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Samd11Q1RNF8 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Samd11Q1RNF8 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Samd11Q1RNF8 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Samd11Q1RNF8 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Samd11Q1RNF8 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Samd11Q1RNF8 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Samd11Q1RNF8 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Samd11Q1RNF8 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Samd11Q1RNF8 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Samd11Q1RNF8 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Samd11Q1RNF8 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Samd11Q1RNF8 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Samd11Q1RNF8 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms