Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trim71Q1PSW8 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trim71Q1PSW8 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trim71Q1PSW8 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trim71Q1PSW8 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trim71Q1PSW8 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trim71Q1PSW8 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trim71Q1PSW8 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trim71Q1PSW8 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trim71Q1PSW8 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trim71Q1PSW8 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trim71Q1PSW8 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trim71Q1PSW8 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trim71Q1PSW8 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trim71Q1PSW8 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trim71Q1PSW8 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trim71Q1PSW8 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trim71Q1PSW8 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Trim71Q1PSW8 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Trim71Q1PSW8 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trim71Q1PSW8 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trim71Q1PSW8 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trim71Q1PSW8 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trim71Q1PSW8 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trim71Q1PSW8 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trim71Q1PSW8 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trim71Q1PSW8 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trim71Q1PSW8 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Trim71Q1PSW8 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trim71Q1PSW8 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trim71Q1PSW8 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trim71Q1PSW8 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trim71Q1PSW8 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Trim71Q1PSW8 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Trim71Q1PSW8 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Trim71Q1PSW8 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Trim71Q1PSW8 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Trim71Q1PSW8 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Trim71Q1PSW8 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Trim71Q1PSW8 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Trim71Q1PSW8 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Trim71Q1PSW8 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Trim71Q1PSW8 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Trim71Q1PSW8 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Trim71Q1PSW8 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Trim71Q1PSW8 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Trim71Q1PSW8 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Trim71Q1PSW8 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Trim71Q1PSW8 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Trim71Q1PSW8 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Trim71Q1PSW8 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Trim71Q1PSW8 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Trim71Q1PSW8 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Trim71Q1PSW8 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Trim71Q1PSW8 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Trim71Q1PSW8 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Trim71Q1PSW8 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Trim71Q1PSW8 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Trim71Q1PSW8 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Trim71Q1PSW8 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Trim71Q1PSW8 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Trim71Q1PSW8 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Trim71Q1PSW8 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Trim71Q1PSW8 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Trim71Q1PSW8 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Trim71Q1PSW8 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Trim71Q1PSW8 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Trim71Q1PSW8 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Trim71Q1PSW8 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Trim71Q1PSW8 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Trim71Q1PSW8 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Trim71Q1PSW8 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trim71Q1PSW8 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trim71Q1PSW8 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trim71Q1PSW8 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Trim71Q1PSW8 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trim71Q1PSW8 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trim71Q1PSW8 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trim71Q1PSW8 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trim71Q1PSW8 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trim71Q1PSW8 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trim71Q1PSW8 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trim71Q1PSW8 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trim71Q1PSW8 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trim71Q1PSW8 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trim71Q1PSW8 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trim71Q1PSW8 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trim71Q1PSW8 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trim71Q1PSW8 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trim71Q1PSW8 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trim71Q1PSW8 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trim71Q1PSW8 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trim71Q1PSW8 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trim71Q1PSW8 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Trim71Q1PSW8 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Trim71Q1PSW8 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trim71Q1PSW8 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trim71Q1PSW8 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Trim71Q1PSW8 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Trim71Q1PSW8 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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