Protein–RNA interactions for Protein: Q14B62

ptchd1, Patched domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 888 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ptchd1Q14B62 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
ptchd1Q14B62 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ptchd1Q14B62 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
ptchd1Q14B62 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ptchd1Q14B62 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ptchd1Q14B62 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ptchd1Q14B62 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ptchd1Q14B62 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ptchd1Q14B62 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ptchd1Q14B62 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ptchd1Q14B62 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ptchd1Q14B62 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ptchd1Q14B62 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
ptchd1Q14B62 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ptchd1Q14B62 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ptchd1Q14B62 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ptchd1Q14B62 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ptchd1Q14B62 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ptchd1Q14B62 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ptchd1Q14B62 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ptchd1Q14B62 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ptchd1Q14B62 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ptchd1Q14B62 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ptchd1Q14B62 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ptchd1Q14B62 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ptchd1Q14B62 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
ptchd1Q14B62 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ptchd1Q14B62 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
ptchd1Q14B62 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ptchd1Q14B62 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ptchd1Q14B62 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
ptchd1Q14B62 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ptchd1Q14B62 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ptchd1Q14B62 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
ptchd1Q14B62 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
ptchd1Q14B62 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ptchd1Q14B62 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ptchd1Q14B62 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ptchd1Q14B62 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
ptchd1Q14B62 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ptchd1Q14B62 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
ptchd1Q14B62 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
ptchd1Q14B62 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
ptchd1Q14B62 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ptchd1Q14B62 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
ptchd1Q14B62 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
ptchd1Q14B62 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
ptchd1Q14B62 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
ptchd1Q14B62 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ptchd1Q14B62 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ptchd1Q14B62 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ptchd1Q14B62 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ptchd1Q14B62 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ptchd1Q14B62 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ptchd1Q14B62 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ptchd1Q14B62 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ptchd1Q14B62 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ptchd1Q14B62 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ptchd1Q14B62 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ptchd1Q14B62 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
ptchd1Q14B62 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ptchd1Q14B62 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ptchd1Q14B62 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ptchd1Q14B62 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ptchd1Q14B62 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ptchd1Q14B62 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ptchd1Q14B62 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ptchd1Q14B62 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ptchd1Q14B62 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
ptchd1Q14B62 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
ptchd1Q14B62 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ptchd1Q14B62 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ptchd1Q14B62 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ptchd1Q14B62 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ptchd1Q14B62 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ptchd1Q14B62 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ptchd1Q14B62 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ptchd1Q14B62 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ptchd1Q14B62 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
ptchd1Q14B62 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ptchd1Q14B62 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ptchd1Q14B62 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ptchd1Q14B62 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
ptchd1Q14B62 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ptchd1Q14B62 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ptchd1Q14B62 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ptchd1Q14B62 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
ptchd1Q14B62 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ptchd1Q14B62 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
ptchd1Q14B62 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ptchd1Q14B62 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
ptchd1Q14B62 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ptchd1Q14B62 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ptchd1Q14B62 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
ptchd1Q14B62 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ptchd1Q14B62 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ptchd1Q14B62 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ptchd1Q14B62 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ptchd1Q14B62 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ptchd1Q14B62 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.8 ms