Protein–RNA interactions for Protein: Q149C2

Traf3ip1, TRAF3-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 625 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3ip1Q149C2 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Traf3ip1Q149C2 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Traf3ip1Q149C2 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Traf3ip1Q149C2 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Traf3ip1Q149C2 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Traf3ip1Q149C2 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Traf3ip1Q149C2 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Traf3ip1Q149C2 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Traf3ip1Q149C2 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Traf3ip1Q149C2 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Traf3ip1Q149C2 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Traf3ip1Q149C2 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Traf3ip1Q149C2 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Traf3ip1Q149C2 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Traf3ip1Q149C2 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Traf3ip1Q149C2 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Traf3ip1Q149C2 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Traf3ip1Q149C2 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Traf3ip1Q149C2 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Traf3ip1Q149C2 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Traf3ip1Q149C2 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Traf3ip1Q149C2 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Traf3ip1Q149C2 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Traf3ip1Q149C2 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Traf3ip1Q149C2 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Traf3ip1Q149C2 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Traf3ip1Q149C2 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Traf3ip1Q149C2 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Traf3ip1Q149C2 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Traf3ip1Q149C2 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Traf3ip1Q149C2 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Traf3ip1Q149C2 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Traf3ip1Q149C2 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Traf3ip1Q149C2 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Traf3ip1Q149C2 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Traf3ip1Q149C2 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Traf3ip1Q149C2 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Traf3ip1Q149C2 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Traf3ip1Q149C2 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Traf3ip1Q149C2 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Traf3ip1Q149C2 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Traf3ip1Q149C2 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Traf3ip1Q149C2 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Traf3ip1Q149C2 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Traf3ip1Q149C2 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Traf3ip1Q149C2 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Traf3ip1Q149C2 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Traf3ip1Q149C2 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Traf3ip1Q149C2 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
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Traf3ip1Q149C2 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Traf3ip1Q149C2 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Traf3ip1Q149C2 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
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Traf3ip1Q149C2 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Traf3ip1Q149C2 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Traf3ip1Q149C2 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Traf3ip1Q149C2 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Traf3ip1Q149C2 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Traf3ip1Q149C2 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Traf3ip1Q149C2 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Traf3ip1Q149C2 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Traf3ip1Q149C2 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Traf3ip1Q149C2 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Traf3ip1Q149C2 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Traf3ip1Q149C2 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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Traf3ip1Q149C2 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Traf3ip1Q149C2 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Traf3ip1Q149C2 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Traf3ip1Q149C2 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Traf3ip1Q149C2 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Traf3ip1Q149C2 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Traf3ip1Q149C2 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Traf3ip1Q149C2 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Traf3ip1Q149C2 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Traf3ip1Q149C2 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Traf3ip1Q149C2 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Traf3ip1Q149C2 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Traf3ip1Q149C2 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Traf3ip1Q149C2 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Traf3ip1Q149C2 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Traf3ip1Q149C2 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Traf3ip1Q149C2 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Traf3ip1Q149C2 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Traf3ip1Q149C2 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Traf3ip1Q149C2 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Traf3ip1Q149C2 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Traf3ip1Q149C2 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Traf3ip1Q149C2 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
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Traf3ip1Q149C2 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Traf3ip1Q149C2 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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Traf3ip1Q149C2 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Traf3ip1Q149C2 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Traf3ip1Q149C2 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Traf3ip1Q149C2 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Traf3ip1Q149C2 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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