Protein–RNA interactions for Protein: Q149B8

Perm1, PGC-1 and ERR-induced regulator in muscle protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 807 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Perm1Q149B8 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Perm1Q149B8 C230062I16Rik-204ENSMUST00000208342 643 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Perm1Q149B8 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Perm1Q149B8 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Perm1Q149B8 Krtap5-1-201ENSMUST00000084413 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Perm1Q149B8 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Perm1Q149B8 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Perm1Q149B8 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Perm1Q149B8 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Perm1Q149B8 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Perm1Q149B8 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Perm1Q149B8 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Perm1Q149B8 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Perm1Q149B8 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Perm1Q149B8 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Perm1Q149B8 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Perm1Q149B8 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Perm1Q149B8 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC13.21□□□□□ -0.3
Perm1Q149B8 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Perm1Q149B8 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Perm1Q149B8 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Perm1Q149B8 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Perm1Q149B8 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Perm1Q149B8 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Perm1Q149B8 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Perm1Q149B8 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Perm1Q149B8 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Perm1Q149B8 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Perm1Q149B8 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Perm1Q149B8 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Perm1Q149B8 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Perm1Q149B8 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Perm1Q149B8 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Perm1Q149B8 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Perm1Q149B8 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Perm1Q149B8 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Perm1Q149B8 Gm3625-201ENSMUST00000170816 102 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Perm1Q149B8 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Perm1Q149B8 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Perm1Q149B8 Gm14267-206ENSMUST00000226870 1209 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Perm1Q149B8 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Perm1Q149B8 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Perm1Q149B8 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Perm1Q149B8 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Perm1Q149B8 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Perm1Q149B8 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Perm1Q149B8 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Perm1Q149B8 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Perm1Q149B8 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Perm1Q149B8 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Perm1Q149B8 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Perm1Q149B8 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Perm1Q149B8 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Perm1Q149B8 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Perm1Q149B8 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Perm1Q149B8 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Perm1Q149B8 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Perm1Q149B8 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Perm1Q149B8 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Perm1Q149B8 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Perm1Q149B8 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Perm1Q149B8 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Perm1Q149B8 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Perm1Q149B8 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Perm1Q149B8 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Perm1Q149B8 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Perm1Q149B8 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Perm1Q149B8 Gm12616-201ENSMUST00000118594 382 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Perm1Q149B8 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Perm1Q149B8 Mir1943-201ENSMUST00000158276 73 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Perm1Q149B8 Gm20426-201ENSMUST00000173657 440 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Perm1Q149B8 Gm12624-201ENSMUST00000177615 382 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Perm1Q149B8 Gm12621-201ENSMUST00000177760 382 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Perm1Q149B8 Gm12615-201ENSMUST00000177970 382 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Perm1Q149B8 Gm12622-201ENSMUST00000177975 382 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Perm1Q149B8 Gm12627-201ENSMUST00000178412 382 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Perm1Q149B8 Gm12625-201ENSMUST00000179122 382 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Perm1Q149B8 Gm12614-201ENSMUST00000179586 382 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Perm1Q149B8 Gm12613-201ENSMUST00000180323 382 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Perm1Q149B8 Gm42817-201ENSMUST00000198962 607 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Perm1Q149B8 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Perm1Q149B8 Gm10109-202ENSMUST00000206890 1211 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Perm1Q149B8 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Perm1Q149B8 Gm10109-201ENSMUST00000072123 1078 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Perm1Q149B8 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Perm1Q149B8 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Perm1Q149B8 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Perm1Q149B8 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Perm1Q149B8 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Perm1Q149B8 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Perm1Q149B8 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Perm1Q149B8 Batf2-201ENSMUST00000045042 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Perm1Q149B8 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Perm1Q149B8 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Perm1Q149B8 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Perm1Q149B8 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Perm1Q149B8 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Perm1Q149B8 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Perm1Q149B8 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Perm1Q149B8 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms