Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF55

Atp2b3, Calcium-transporting ATPase, mousemouse

Predictions only

Length 1,220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2b3Q0VF55 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atp2b3Q0VF55 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atp2b3Q0VF55 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atp2b3Q0VF55 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atp2b3Q0VF55 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Atp2b3Q0VF55 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atp2b3Q0VF55 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atp2b3Q0VF55 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atp2b3Q0VF55 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Atp2b3Q0VF55 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atp2b3Q0VF55 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Atp2b3Q0VF55 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atp2b3Q0VF55 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atp2b3Q0VF55 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atp2b3Q0VF55 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atp2b3Q0VF55 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Atp2b3Q0VF55 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Atp2b3Q0VF55 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atp2b3Q0VF55 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atp2b3Q0VF55 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atp2b3Q0VF55 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atp2b3Q0VF55 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atp2b3Q0VF55 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atp2b3Q0VF55 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atp2b3Q0VF55 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atp2b3Q0VF55 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atp2b3Q0VF55 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atp2b3Q0VF55 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atp2b3Q0VF55 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atp2b3Q0VF55 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atp2b3Q0VF55 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atp2b3Q0VF55 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atp2b3Q0VF55 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atp2b3Q0VF55 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Atp2b3Q0VF55 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atp2b3Q0VF55 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atp2b3Q0VF55 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atp2b3Q0VF55 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Atp2b3Q0VF55 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atp2b3Q0VF55 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Atp2b3Q0VF55 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atp2b3Q0VF55 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atp2b3Q0VF55 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atp2b3Q0VF55 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Atp2b3Q0VF55 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atp2b3Q0VF55 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atp2b3Q0VF55 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atp2b3Q0VF55 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atp2b3Q0VF55 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atp2b3Q0VF55 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atp2b3Q0VF55 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atp2b3Q0VF55 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atp2b3Q0VF55 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atp2b3Q0VF55 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atp2b3Q0VF55 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atp2b3Q0VF55 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atp2b3Q0VF55 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atp2b3Q0VF55 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atp2b3Q0VF55 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atp2b3Q0VF55 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atp2b3Q0VF55 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atp2b3Q0VF55 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atp2b3Q0VF55 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atp2b3Q0VF55 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atp2b3Q0VF55 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atp2b3Q0VF55 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atp2b3Q0VF55 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atp2b3Q0VF55 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atp2b3Q0VF55 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atp2b3Q0VF55 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Atp2b3Q0VF55 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atp2b3Q0VF55 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atp2b3Q0VF55 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atp2b3Q0VF55 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atp2b3Q0VF55 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atp2b3Q0VF55 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atp2b3Q0VF55 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atp2b3Q0VF55 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atp2b3Q0VF55 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Atp2b3Q0VF55 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atp2b3Q0VF55 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Atp2b3Q0VF55 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Atp2b3Q0VF55 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atp2b3Q0VF55 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atp2b3Q0VF55 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atp2b3Q0VF55 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atp2b3Q0VF55 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atp2b3Q0VF55 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atp2b3Q0VF55 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Atp2b3Q0VF55 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atp2b3Q0VF55 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atp2b3Q0VF55 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Atp2b3Q0VF55 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atp2b3Q0VF55 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atp2b3Q0VF55 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atp2b3Q0VF55 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atp2b3Q0VF55 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atp2b3Q0VF55 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atp2b3Q0VF55 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atp2b3Q0VF55 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.6 ms