Protein–RNA interactions for Protein: Q0HA38

Ttc21b, Tetratricopeptide repeat protein 21B, mousemouse

Predictions only

Length 1,315 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc21bQ0HA38 Apoe-208ENSMUST00000174191 472 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ttc21bQ0HA38 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Ttc21bQ0HA38 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ttc21bQ0HA38 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ttc21bQ0HA38 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ttc21bQ0HA38 Rpl10a-201ENSMUST00000042334 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ttc21bQ0HA38 Olfr887-201ENSMUST00000074681 930 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ttc21bQ0HA38 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ttc21bQ0HA38 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ttc21bQ0HA38 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ttc21bQ0HA38 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ttc21bQ0HA38 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ttc21bQ0HA38 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ttc21bQ0HA38 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ttc21bQ0HA38 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ttc21bQ0HA38 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ttc21bQ0HA38 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ttc21bQ0HA38 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ttc21bQ0HA38 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ttc21bQ0HA38 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ttc21bQ0HA38 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ttc21bQ0HA38 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ttc21bQ0HA38 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ttc21bQ0HA38 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ttc21bQ0HA38 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
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Ttc21bQ0HA38 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ttc21bQ0HA38 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ttc21bQ0HA38 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Ttc21bQ0HA38 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ttc21bQ0HA38 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ttc21bQ0HA38 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ttc21bQ0HA38 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ttc21bQ0HA38 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ttc21bQ0HA38 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ttc21bQ0HA38 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
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Ttc21bQ0HA38 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ttc21bQ0HA38 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ttc21bQ0HA38 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ttc21bQ0HA38 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ttc21bQ0HA38 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
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Ttc21bQ0HA38 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ttc21bQ0HA38 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ttc21bQ0HA38 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ttc21bQ0HA38 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ttc21bQ0HA38 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
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Ttc21bQ0HA38 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ttc21bQ0HA38 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ttc21bQ0HA38 Gm11985-201ENSMUST00000122910 1007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
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Ttc21bQ0HA38 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
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Ttc21bQ0HA38 Ntan1-201ENSMUST00000023362 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ttc21bQ0HA38 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ttc21bQ0HA38 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ttc21bQ0HA38 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
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Ttc21bQ0HA38 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ttc21bQ0HA38 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ttc21bQ0HA38 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
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Ttc21bQ0HA38 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ttc21bQ0HA38 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ttc21bQ0HA38 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ttc21bQ0HA38 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ttc21bQ0HA38 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ttc21bQ0HA38 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ttc21bQ0HA38 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ttc21bQ0HA38 Gm27552-201ENSMUST00000183351 62 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Ttc21bQ0HA38 Gm27844-201ENSMUST00000183613 62 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Ttc21bQ0HA38 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ttc21bQ0HA38 CT025694.1-201ENSMUST00000226188 934 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Ttc21bQ0HA38 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ttc21bQ0HA38 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ttc21bQ0HA38 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Ttc21bQ0HA38 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ttc21bQ0HA38 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ttc21bQ0HA38 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Ttc21bQ0HA38 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ttc21bQ0HA38 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ttc21bQ0HA38 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ttc21bQ0HA38 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ttc21bQ0HA38 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ttc21bQ0HA38 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ttc21bQ0HA38 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ttc21bQ0HA38 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ttc21bQ0HA38 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ttc21bQ0HA38 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ttc21bQ0HA38 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ttc21bQ0HA38 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ttc21bQ0HA38 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ttc21bQ0HA38 Gm16481-201ENSMUST00000119074 1227 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Ttc21bQ0HA38 Gm11331-201ENSMUST00000119764 288 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Ttc21bQ0HA38 Dusp13-204ENSMUST00000120984 976 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
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