Protein–RNA interactions for Protein: Q0GGX2

Znf541, Zinc finger protein 541, mousemouse

Predictions only

Length 1,363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf541Q0GGX2 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Znf541Q0GGX2 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Znf541Q0GGX2 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Znf541Q0GGX2 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Znf541Q0GGX2 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Znf541Q0GGX2 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Znf541Q0GGX2 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Znf541Q0GGX2 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Znf541Q0GGX2 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Znf541Q0GGX2 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Znf541Q0GGX2 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Znf541Q0GGX2 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Znf541Q0GGX2 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Znf541Q0GGX2 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Znf541Q0GGX2 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Znf541Q0GGX2 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Znf541Q0GGX2 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Znf541Q0GGX2 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Znf541Q0GGX2 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Znf541Q0GGX2 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Znf541Q0GGX2 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Znf541Q0GGX2 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Znf541Q0GGX2 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Znf541Q0GGX2 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Znf541Q0GGX2 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Znf541Q0GGX2 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Znf541Q0GGX2 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Znf541Q0GGX2 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Znf541Q0GGX2 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Znf541Q0GGX2 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Znf541Q0GGX2 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Znf541Q0GGX2 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Znf541Q0GGX2 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Znf541Q0GGX2 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Znf541Q0GGX2 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Znf541Q0GGX2 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Znf541Q0GGX2 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Znf541Q0GGX2 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Znf541Q0GGX2 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Znf541Q0GGX2 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Znf541Q0GGX2 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Znf541Q0GGX2 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Znf541Q0GGX2 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Znf541Q0GGX2 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Znf541Q0GGX2 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Znf541Q0GGX2 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Znf541Q0GGX2 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Znf541Q0GGX2 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Znf541Q0GGX2 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Znf541Q0GGX2 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Znf541Q0GGX2 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Znf541Q0GGX2 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Znf541Q0GGX2 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Znf541Q0GGX2 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Znf541Q0GGX2 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Znf541Q0GGX2 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Znf541Q0GGX2 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Znf541Q0GGX2 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Znf541Q0GGX2 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Znf541Q0GGX2 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Znf541Q0GGX2 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Znf541Q0GGX2 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Znf541Q0GGX2 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Znf541Q0GGX2 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Znf541Q0GGX2 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Znf541Q0GGX2 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Znf541Q0GGX2 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Znf541Q0GGX2 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Znf541Q0GGX2 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Znf541Q0GGX2 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Znf541Q0GGX2 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Znf541Q0GGX2 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Znf541Q0GGX2 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Znf541Q0GGX2 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Znf541Q0GGX2 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Znf541Q0GGX2 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Znf541Q0GGX2 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Znf541Q0GGX2 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Znf541Q0GGX2 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Znf541Q0GGX2 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Znf541Q0GGX2 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Znf541Q0GGX2 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Znf541Q0GGX2 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Znf541Q0GGX2 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Znf541Q0GGX2 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Znf541Q0GGX2 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Znf541Q0GGX2 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Znf541Q0GGX2 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Znf541Q0GGX2 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Znf541Q0GGX2 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Znf541Q0GGX2 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Znf541Q0GGX2 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Znf541Q0GGX2 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Znf541Q0GGX2 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Znf541Q0GGX2 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Znf541Q0GGX2 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Znf541Q0GGX2 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Znf541Q0GGX2 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Znf541Q0GGX2 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Znf541Q0GGX2 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms