Protein–RNA interactions for Protein: Q08331

Calb2, Calretinin, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calb2Q08331 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Calb2Q08331 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Calb2Q08331 Slc44a1-204ENSMUST00000107647 2176 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Calb2Q08331 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Calb2Q08331 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Calb2Q08331 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Calb2Q08331 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Calb2Q08331 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Calb2Q08331 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Calb2Q08331 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Calb2Q08331 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Calb2Q08331 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Calb2Q08331 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Calb2Q08331 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Calb2Q08331 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Calb2Q08331 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Calb2Q08331 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Calb2Q08331 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Calb2Q08331 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Calb2Q08331 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Calb2Q08331 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Calb2Q08331 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Calb2Q08331 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Calb2Q08331 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Calb2Q08331 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Calb2Q08331 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Calb2Q08331 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC12.96□□□□□ -0.34
Calb2Q08331 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Calb2Q08331 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Calb2Q08331 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Calb2Q08331 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC12.96□□□□□ -0.34
Calb2Q08331 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Calb2Q08331 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Calb2Q08331 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Calb2Q08331 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Calb2Q08331 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Calb2Q08331 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Calb2Q08331 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Calb2Q08331 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Calb2Q08331 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Calb2Q08331 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Calb2Q08331 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Calb2Q08331 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Calb2Q08331 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Calb2Q08331 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Calb2Q08331 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Calb2Q08331 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Calb2Q08331 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Calb2Q08331 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Calb2Q08331 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Calb2Q08331 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Calb2Q08331 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Calb2Q08331 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Calb2Q08331 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Calb2Q08331 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Calb2Q08331 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Calb2Q08331 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Calb2Q08331 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Calb2Q08331 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Calb2Q08331 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Calb2Q08331 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Calb2Q08331 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Calb2Q08331 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Calb2Q08331 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Calb2Q08331 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Calb2Q08331 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Calb2Q08331 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Calb2Q08331 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Calb2Q08331 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Calb2Q08331 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Calb2Q08331 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Calb2Q08331 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Calb2Q08331 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Calb2Q08331 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Calb2Q08331 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Calb2Q08331 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Calb2Q08331 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Calb2Q08331 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Calb2Q08331 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Calb2Q08331 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Calb2Q08331 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Calb2Q08331 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Calb2Q08331 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Calb2Q08331 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Calb2Q08331 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Calb2Q08331 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Calb2Q08331 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Calb2Q08331 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Calb2Q08331 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Calb2Q08331 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Calb2Q08331 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Calb2Q08331 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Calb2Q08331 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Calb2Q08331 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Calb2Q08331 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Calb2Q08331 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Calb2Q08331 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Calb2Q08331 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Calb2Q08331 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Calb2Q08331 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms