Protein–RNA interactions for Protein: Q08288

Lyar, Cell growth-regulating nucleolar protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LyarQ08288 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LyarQ08288 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LyarQ08288 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LyarQ08288 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LyarQ08288 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LyarQ08288 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LyarQ08288 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LyarQ08288 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LyarQ08288 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LyarQ08288 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LyarQ08288 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
LyarQ08288 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LyarQ08288 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LyarQ08288 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LyarQ08288 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
LyarQ08288 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
LyarQ08288 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
LyarQ08288 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
LyarQ08288 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LyarQ08288 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
LyarQ08288 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LyarQ08288 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LyarQ08288 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LyarQ08288 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LyarQ08288 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LyarQ08288 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LyarQ08288 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LyarQ08288 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LyarQ08288 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LyarQ08288 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LyarQ08288 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LyarQ08288 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LyarQ08288 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
LyarQ08288 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
LyarQ08288 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LyarQ08288 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LyarQ08288 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LyarQ08288 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LyarQ08288 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LyarQ08288 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LyarQ08288 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LyarQ08288 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LyarQ08288 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LyarQ08288 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LyarQ08288 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LyarQ08288 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LyarQ08288 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LyarQ08288 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LyarQ08288 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LyarQ08288 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LyarQ08288 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LyarQ08288 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LyarQ08288 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LyarQ08288 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LyarQ08288 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
LyarQ08288 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LyarQ08288 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LyarQ08288 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LyarQ08288 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
LyarQ08288 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LyarQ08288 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LyarQ08288 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LyarQ08288 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LyarQ08288 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LyarQ08288 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LyarQ08288 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LyarQ08288 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LyarQ08288 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LyarQ08288 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LyarQ08288 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LyarQ08288 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LyarQ08288 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LyarQ08288 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LyarQ08288 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LyarQ08288 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LyarQ08288 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LyarQ08288 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
LyarQ08288 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
LyarQ08288 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
LyarQ08288 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LyarQ08288 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LyarQ08288 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LyarQ08288 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LyarQ08288 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LyarQ08288 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LyarQ08288 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LyarQ08288 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LyarQ08288 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LyarQ08288 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LyarQ08288 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LyarQ08288 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LyarQ08288 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LyarQ08288 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LyarQ08288 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LyarQ08288 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LyarQ08288 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
LyarQ08288 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LyarQ08288 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LyarQ08288 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LyarQ08288 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms