Protein–RNA interactions for Protein: Q08093

Cnn2, Calponin-2, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnn2Q08093 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cnn2Q08093 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cnn2Q08093 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cnn2Q08093 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cnn2Q08093 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cnn2Q08093 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Cnn2Q08093 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cnn2Q08093 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Cnn2Q08093 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Cnn2Q08093 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Cnn2Q08093 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Cnn2Q08093 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Cnn2Q08093 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cnn2Q08093 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cnn2Q08093 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cnn2Q08093 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cnn2Q08093 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cnn2Q08093 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cnn2Q08093 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cnn2Q08093 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cnn2Q08093 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cnn2Q08093 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cnn2Q08093 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cnn2Q08093 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cnn2Q08093 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cnn2Q08093 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cnn2Q08093 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cnn2Q08093 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cnn2Q08093 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Cnn2Q08093 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cnn2Q08093 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cnn2Q08093 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cnn2Q08093 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Cnn2Q08093 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Cnn2Q08093 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Cnn2Q08093 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Cnn2Q08093 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cnn2Q08093 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cnn2Q08093 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cnn2Q08093 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cnn2Q08093 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Cnn2Q08093 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cnn2Q08093 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cnn2Q08093 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cnn2Q08093 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cnn2Q08093 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cnn2Q08093 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cnn2Q08093 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Cnn2Q08093 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Cnn2Q08093 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Cnn2Q08093 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Cnn2Q08093 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Cnn2Q08093 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cnn2Q08093 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cnn2Q08093 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cnn2Q08093 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Cnn2Q08093 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Cnn2Q08093 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Cnn2Q08093 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Cnn2Q08093 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Cnn2Q08093 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cnn2Q08093 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cnn2Q08093 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cnn2Q08093 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cnn2Q08093 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cnn2Q08093 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cnn2Q08093 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cnn2Q08093 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cnn2Q08093 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cnn2Q08093 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cnn2Q08093 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cnn2Q08093 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cnn2Q08093 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cnn2Q08093 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cnn2Q08093 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cnn2Q08093 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cnn2Q08093 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cnn2Q08093 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cnn2Q08093 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cnn2Q08093 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cnn2Q08093 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cnn2Q08093 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cnn2Q08093 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cnn2Q08093 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cnn2Q08093 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Cnn2Q08093 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cnn2Q08093 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cnn2Q08093 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cnn2Q08093 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cnn2Q08093 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Cnn2Q08093 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cnn2Q08093 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cnn2Q08093 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cnn2Q08093 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cnn2Q08093 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cnn2Q08093 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cnn2Q08093 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cnn2Q08093 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cnn2Q08093 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Cnn2Q08093 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms