Protein–RNA interactions for Protein: Q06985

Siah1b, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH1B, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah1bQ06985 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Siah1bQ06985 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Siah1bQ06985 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Siah1bQ06985 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Siah1bQ06985 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Siah1bQ06985 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Siah1bQ06985 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Siah1bQ06985 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Siah1bQ06985 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Siah1bQ06985 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Siah1bQ06985 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Siah1bQ06985 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Siah1bQ06985 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Siah1bQ06985 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Siah1bQ06985 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Siah1bQ06985 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Siah1bQ06985 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Siah1bQ06985 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Siah1bQ06985 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Siah1bQ06985 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Siah1bQ06985 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Siah1bQ06985 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Siah1bQ06985 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Siah1bQ06985 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Siah1bQ06985 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Siah1bQ06985 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Siah1bQ06985 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Siah1bQ06985 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Siah1bQ06985 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Siah1bQ06985 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Siah1bQ06985 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Siah1bQ06985 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Siah1bQ06985 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Siah1bQ06985 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Siah1bQ06985 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Siah1bQ06985 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Siah1bQ06985 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Siah1bQ06985 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Siah1bQ06985 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Siah1bQ06985 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Siah1bQ06985 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Siah1bQ06985 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Siah1bQ06985 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Siah1bQ06985 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Siah1bQ06985 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Siah1bQ06985 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Siah1bQ06985 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Siah1bQ06985 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Siah1bQ06985 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Siah1bQ06985 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Siah1bQ06985 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Siah1bQ06985 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Siah1bQ06985 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Siah1bQ06985 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Siah1bQ06985 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Siah1bQ06985 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Siah1bQ06985 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Siah1bQ06985 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Siah1bQ06985 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Siah1bQ06985 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Siah1bQ06985 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Siah1bQ06985 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Siah1bQ06985 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Siah1bQ06985 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Siah1bQ06985 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Siah1bQ06985 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Siah1bQ06985 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Siah1bQ06985 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Siah1bQ06985 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Siah1bQ06985 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Siah1bQ06985 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Siah1bQ06985 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Siah1bQ06985 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Siah1bQ06985 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Siah1bQ06985 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Siah1bQ06985 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Siah1bQ06985 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Siah1bQ06985 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Siah1bQ06985 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Siah1bQ06985 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Siah1bQ06985 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Siah1bQ06985 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Siah1bQ06985 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Siah1bQ06985 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Siah1bQ06985 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Siah1bQ06985 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Siah1bQ06985 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Siah1bQ06985 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Siah1bQ06985 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Siah1bQ06985 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Siah1bQ06985 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Siah1bQ06985 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Siah1bQ06985 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Siah1bQ06985 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Siah1bQ06985 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Siah1bQ06985 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Siah1bQ06985 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Siah1bQ06985 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Siah1bQ06985 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Siah1bQ06985 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms