Protein–RNA interactions for Protein: Q06649

Sh3bp2, SH3 domain-binding protein 2, mousemouse

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp2Q06649 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Sh3bp2Q06649 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Sh3bp2Q06649 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Sh3bp2Q06649 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Sh3bp2Q06649 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Sh3bp2Q06649 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Sh3bp2Q06649 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Sh3bp2Q06649 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Sh3bp2Q06649 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Sh3bp2Q06649 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Sh3bp2Q06649 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Sh3bp2Q06649 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Sh3bp2Q06649 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Sh3bp2Q06649 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Sh3bp2Q06649 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Sh3bp2Q06649 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Sh3bp2Q06649 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Sh3bp2Q06649 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Sh3bp2Q06649 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Sh3bp2Q06649 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Sh3bp2Q06649 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Sh3bp2Q06649 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Sh3bp2Q06649 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Sh3bp2Q06649 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Sh3bp2Q06649 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Sh3bp2Q06649 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Sh3bp2Q06649 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Sh3bp2Q06649 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Sh3bp2Q06649 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Sh3bp2Q06649 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Sh3bp2Q06649 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Sh3bp2Q06649 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Sh3bp2Q06649 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Sh3bp2Q06649 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Sh3bp2Q06649 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Sh3bp2Q06649 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Sh3bp2Q06649 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Sh3bp2Q06649 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Sh3bp2Q06649 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Sh3bp2Q06649 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Sh3bp2Q06649 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Sh3bp2Q06649 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Sh3bp2Q06649 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Sh3bp2Q06649 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
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Sh3bp2Q06649 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Sh3bp2Q06649 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
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Sh3bp2Q06649 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Sh3bp2Q06649 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
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Sh3bp2Q06649 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
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Sh3bp2Q06649 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Sh3bp2Q06649 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Sh3bp2Q06649 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Sh3bp2Q06649 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Sh3bp2Q06649 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Sh3bp2Q06649 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Sh3bp2Q06649 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Sh3bp2Q06649 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Sh3bp2Q06649 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Sh3bp2Q06649 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Sh3bp2Q06649 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Sh3bp2Q06649 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Sh3bp2Q06649 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Sh3bp2Q06649 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Sh3bp2Q06649 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Sh3bp2Q06649 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Sh3bp2Q06649 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Sh3bp2Q06649 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Sh3bp2Q06649 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Sh3bp2Q06649 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Sh3bp2Q06649 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Sh3bp2Q06649 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Sh3bp2Q06649 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Sh3bp2Q06649 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Sh3bp2Q06649 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Sh3bp2Q06649 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
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