Protein–RNA interactions for Protein: Q05895

Thbs3, Thrombospondin-3, mousemouse

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Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thbs3Q05895 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Thbs3Q05895 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Thbs3Q05895 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Thbs3Q05895 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Thbs3Q05895 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Thbs3Q05895 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Thbs3Q05895 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Thbs3Q05895 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Thbs3Q05895 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Thbs3Q05895 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Thbs3Q05895 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Thbs3Q05895 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Thbs3Q05895 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Thbs3Q05895 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Thbs3Q05895 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Thbs3Q05895 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Thbs3Q05895 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Thbs3Q05895 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Thbs3Q05895 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Thbs3Q05895 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Thbs3Q05895 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Thbs3Q05895 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Thbs3Q05895 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Thbs3Q05895 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Thbs3Q05895 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Thbs3Q05895 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Thbs3Q05895 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Thbs3Q05895 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Thbs3Q05895 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Thbs3Q05895 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Thbs3Q05895 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Thbs3Q05895 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Thbs3Q05895 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Thbs3Q05895 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Thbs3Q05895 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Thbs3Q05895 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Thbs3Q05895 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Thbs3Q05895 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Thbs3Q05895 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Thbs3Q05895 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Thbs3Q05895 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Thbs3Q05895 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Thbs3Q05895 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Thbs3Q05895 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Thbs3Q05895 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Thbs3Q05895 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Thbs3Q05895 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Thbs3Q05895 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Thbs3Q05895 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Thbs3Q05895 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Thbs3Q05895 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Thbs3Q05895 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Thbs3Q05895 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Thbs3Q05895 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Thbs3Q05895 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Thbs3Q05895 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Thbs3Q05895 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Thbs3Q05895 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Thbs3Q05895 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Thbs3Q05895 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Thbs3Q05895 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Thbs3Q05895 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Thbs3Q05895 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Thbs3Q05895 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Thbs3Q05895 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Thbs3Q05895 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Thbs3Q05895 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Thbs3Q05895 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Thbs3Q05895 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Thbs3Q05895 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Thbs3Q05895 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Thbs3Q05895 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Thbs3Q05895 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Thbs3Q05895 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Thbs3Q05895 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Thbs3Q05895 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Thbs3Q05895 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Thbs3Q05895 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Thbs3Q05895 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Thbs3Q05895 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Thbs3Q05895 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Thbs3Q05895 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Thbs3Q05895 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Thbs3Q05895 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Thbs3Q05895 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Thbs3Q05895 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Thbs3Q05895 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Thbs3Q05895 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Thbs3Q05895 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Thbs3Q05895 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Thbs3Q05895 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Thbs3Q05895 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Thbs3Q05895 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Thbs3Q05895 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Thbs3Q05895 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Thbs3Q05895 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
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