Protein–RNA interactions for Protein: Q05020

Apoc2, Apolipoprotein C-II, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc2Q05020 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Apoc2Q05020 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Apoc2Q05020 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Apoc2Q05020 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Apoc2Q05020 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Apoc2Q05020 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Apoc2Q05020 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Apoc2Q05020 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Apoc2Q05020 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Apoc2Q05020 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Apoc2Q05020 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Apoc2Q05020 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Apoc2Q05020 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Apoc2Q05020 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Apoc2Q05020 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Apoc2Q05020 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Apoc2Q05020 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Apoc2Q05020 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Apoc2Q05020 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Apoc2Q05020 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Apoc2Q05020 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Apoc2Q05020 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Apoc2Q05020 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Apoc2Q05020 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Apoc2Q05020 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Apoc2Q05020 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Apoc2Q05020 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Apoc2Q05020 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Apoc2Q05020 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Apoc2Q05020 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Apoc2Q05020 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Apoc2Q05020 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Apoc2Q05020 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC11.77□□□□□ -0.52
Apoc2Q05020 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Apoc2Q05020 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Apoc2Q05020 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Apoc2Q05020 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Apoc2Q05020 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Apoc2Q05020 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Apoc2Q05020 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Apoc2Q05020 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Apoc2Q05020 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Apoc2Q05020 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Apoc2Q05020 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Apoc2Q05020 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Apoc2Q05020 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Apoc2Q05020 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Apoc2Q05020 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Apoc2Q05020 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Apoc2Q05020 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Apoc2Q05020 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Apoc2Q05020 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Apoc2Q05020 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Apoc2Q05020 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Apoc2Q05020 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Apoc2Q05020 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Apoc2Q05020 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Apoc2Q05020 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Apoc2Q05020 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Apoc2Q05020 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Apoc2Q05020 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Apoc2Q05020 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Apoc2Q05020 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Apoc2Q05020 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Apoc2Q05020 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Apoc2Q05020 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Apoc2Q05020 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Apoc2Q05020 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Apoc2Q05020 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Apoc2Q05020 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Apoc2Q05020 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Apoc2Q05020 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Apoc2Q05020 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Apoc2Q05020 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Apoc2Q05020 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Apoc2Q05020 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Apoc2Q05020 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Apoc2Q05020 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Apoc2Q05020 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Apoc2Q05020 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Apoc2Q05020 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Apoc2Q05020 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Apoc2Q05020 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Apoc2Q05020 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Apoc2Q05020 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Apoc2Q05020 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Apoc2Q05020 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Apoc2Q05020 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Apoc2Q05020 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Apoc2Q05020 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Apoc2Q05020 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Apoc2Q05020 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Apoc2Q05020 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Apoc2Q05020 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Apoc2Q05020 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Apoc2Q05020 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Apoc2Q05020 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Apoc2Q05020 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Apoc2Q05020 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Apoc2Q05020 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.2 ms