Protein–RNA interactions for Protein: Q04690

Nf1, Neurofibromin, mousemouse

Predictions only

Length 2,841 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nf1Q04690 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Nf1Q04690 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Nf1Q04690 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Nf1Q04690 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Nf1Q04690 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Nf1Q04690 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Nf1Q04690 Gm11340-201ENSMUST00000119226 412 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Nf1Q04690 Mir1901-201ENSMUST00000122616 78 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Nf1Q04690 Bnip3-203ENSMUST00000130500 719 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Nf1Q04690 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Nf1Q04690 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Nf1Q04690 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Nf1Q04690 Gm6145-204ENSMUST00000210902 1266 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Nf1Q04690 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Nf1Q04690 Mrpl30-201ENSMUST00000027256 969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Nf1Q04690 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Nf1Q04690 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Nf1Q04690 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Nf1Q04690 Gm10785-201ENSMUST00000156242 1583 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Nf1Q04690 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Nf1Q04690 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Nf1Q04690 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Nf1Q04690 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Nf1Q04690 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Nf1Q04690 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Nf1Q04690 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Nf1Q04690 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Nf1Q04690 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Nf1Q04690 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Nf1Q04690 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Nf1Q04690 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Nf1Q04690 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Nf1Q04690 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Nf1Q04690 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Nf1Q04690 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Nf1Q04690 Gm7666-201ENSMUST00000146631 819 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Nf1Q04690 C730034F03Rik-201ENSMUST00000168646 1280 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Nf1Q04690 Gm17168-201ENSMUST00000169146 345 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Nf1Q04690 Gm40652-201ENSMUST00000218944 895 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Nf1Q04690 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Nf1Q04690 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Nf1Q04690 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Nf1Q04690 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Nf1Q04690 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Nf1Q04690 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Nf1Q04690 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Nf1Q04690 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Nf1Q04690 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Nf1Q04690 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Nf1Q04690 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Nf1Q04690 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Nf1Q04690 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Nf1Q04690 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Nf1Q04690 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
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Nf1Q04690 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Nf1Q04690 Tubb4b-ps2-201ENSMUST00000187481 1337 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Nf1Q04690 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Nf1Q04690 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Nf1Q04690 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Nf1Q04690 Gm6039-201ENSMUST00000121667 1250 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Nf1Q04690 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Nf1Q04690 Gng13-202ENSMUST00000172002 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Nf1Q04690 Gm21057-202ENSMUST00000206111 512 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
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Nf1Q04690 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
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Nf1Q04690 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
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Nf1Q04690 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Nf1Q04690 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
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Nf1Q04690 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
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Nf1Q04690 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Nf1Q04690 Spx-202ENSMUST00000126521 357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Nf1Q04690 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Nf1Q04690 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
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Nf1Q04690 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Nf1Q04690 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Nf1Q04690 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Nf1Q04690 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Nf1Q04690 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Nf1Q04690 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Nf1Q04690 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Nf1Q04690 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Nf1Q04690 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Nf1Q04690 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Nf1Q04690 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Nf1Q04690 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Nf1Q04690 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Nf1Q04690 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Nf1Q04690 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Nf1Q04690 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Nf1Q04690 Ighg2c-201ENSMUST00000103416 1214 ntAPPRIS P5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Nf1Q04690 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Nf1Q04690 Gm16397-201ENSMUST00000122201 494 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.4 ms