Protein–RNA interactions for Protein: Q01815

Cacna1c, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1C, mousemouse

Predictions only

Length 2,139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1cQ01815 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cacna1cQ01815 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cacna1cQ01815 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cacna1cQ01815 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cacna1cQ01815 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cacna1cQ01815 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Cacna1cQ01815 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Cacna1cQ01815 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Cacna1cQ01815 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cacna1cQ01815 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cacna1cQ01815 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cacna1cQ01815 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cacna1cQ01815 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cacna1cQ01815 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cacna1cQ01815 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cacna1cQ01815 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cacna1cQ01815 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cacna1cQ01815 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cacna1cQ01815 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cacna1cQ01815 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cacna1cQ01815 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cacna1cQ01815 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cacna1cQ01815 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cacna1cQ01815 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cacna1cQ01815 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Cacna1cQ01815 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cacna1cQ01815 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cacna1cQ01815 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cacna1cQ01815 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cacna1cQ01815 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cacna1cQ01815 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cacna1cQ01815 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cacna1cQ01815 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cacna1cQ01815 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Cacna1cQ01815 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cacna1cQ01815 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cacna1cQ01815 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cacna1cQ01815 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Cacna1cQ01815 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cacna1cQ01815 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Cacna1cQ01815 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cacna1cQ01815 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cacna1cQ01815 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cacna1cQ01815 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cacna1cQ01815 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cacna1cQ01815 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cacna1cQ01815 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cacna1cQ01815 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cacna1cQ01815 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cacna1cQ01815 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Cacna1cQ01815 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cacna1cQ01815 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cacna1cQ01815 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cacna1cQ01815 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cacna1cQ01815 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cacna1cQ01815 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cacna1cQ01815 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cacna1cQ01815 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cacna1cQ01815 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cacna1cQ01815 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cacna1cQ01815 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cacna1cQ01815 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cacna1cQ01815 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Cacna1cQ01815 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Cacna1cQ01815 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cacna1cQ01815 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cacna1cQ01815 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cacna1cQ01815 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cacna1cQ01815 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cacna1cQ01815 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cacna1cQ01815 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cacna1cQ01815 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cacna1cQ01815 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Cacna1cQ01815 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Cacna1cQ01815 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Cacna1cQ01815 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Cacna1cQ01815 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cacna1cQ01815 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cacna1cQ01815 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cacna1cQ01815 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cacna1cQ01815 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cacna1cQ01815 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cacna1cQ01815 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cacna1cQ01815 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cacna1cQ01815 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cacna1cQ01815 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cacna1cQ01815 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cacna1cQ01815 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cacna1cQ01815 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cacna1cQ01815 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cacna1cQ01815 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cacna1cQ01815 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cacna1cQ01815 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cacna1cQ01815 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cacna1cQ01815 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cacna1cQ01815 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cacna1cQ01815 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cacna1cQ01815 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cacna1cQ01815 Thsd4-202ENSMUST00000098660 8796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cacna1cQ01815 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.8 ms