Protein–RNA interactions for Protein: Q01405

Sec23a, Protein transport protein Sec23A, mousemouse

Predictions only

Length 765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec23aQ01405 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Sec23aQ01405 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sec23aQ01405 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sec23aQ01405 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sec23aQ01405 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sec23aQ01405 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sec23aQ01405 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sec23aQ01405 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sec23aQ01405 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sec23aQ01405 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sec23aQ01405 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sec23aQ01405 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sec23aQ01405 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sec23aQ01405 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sec23aQ01405 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sec23aQ01405 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sec23aQ01405 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sec23aQ01405 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sec23aQ01405 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sec23aQ01405 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sec23aQ01405 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sec23aQ01405 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sec23aQ01405 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sec23aQ01405 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sec23aQ01405 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sec23aQ01405 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sec23aQ01405 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sec23aQ01405 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Sec23aQ01405 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sec23aQ01405 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Sec23aQ01405 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Sec23aQ01405 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sec23aQ01405 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sec23aQ01405 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sec23aQ01405 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sec23aQ01405 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sec23aQ01405 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sec23aQ01405 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sec23aQ01405 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sec23aQ01405 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sec23aQ01405 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sec23aQ01405 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sec23aQ01405 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sec23aQ01405 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sec23aQ01405 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sec23aQ01405 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sec23aQ01405 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sec23aQ01405 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sec23aQ01405 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sec23aQ01405 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sec23aQ01405 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sec23aQ01405 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Sec23aQ01405 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Sec23aQ01405 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sec23aQ01405 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Sec23aQ01405 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Sec23aQ01405 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sec23aQ01405 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Sec23aQ01405 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sec23aQ01405 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sec23aQ01405 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sec23aQ01405 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Sec23aQ01405 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sec23aQ01405 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sec23aQ01405 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sec23aQ01405 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sec23aQ01405 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sec23aQ01405 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sec23aQ01405 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Sec23aQ01405 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sec23aQ01405 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sec23aQ01405 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sec23aQ01405 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Sec23aQ01405 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sec23aQ01405 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sec23aQ01405 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sec23aQ01405 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sec23aQ01405 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sec23aQ01405 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sec23aQ01405 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Sec23aQ01405 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Sec23aQ01405 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Sec23aQ01405 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Sec23aQ01405 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Sec23aQ01405 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Sec23aQ01405 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Sec23aQ01405 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Sec23aQ01405 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Sec23aQ01405 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Sec23aQ01405 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sec23aQ01405 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sec23aQ01405 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Sec23aQ01405 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sec23aQ01405 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sec23aQ01405 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sec23aQ01405 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sec23aQ01405 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sec23aQ01405 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Sec23aQ01405 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sec23aQ01405 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms