Protein–RNA interactions for Protein: Q01231

Gja5, Gap junction alpha-5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja5Q01231 Gm28694-201ENSMUST00000190681 722 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gja5Q01231 Gm18730-201ENSMUST00000218038 343 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Gja5Q01231 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Gja5Q01231 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gja5Q01231 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gja5Q01231 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gja5Q01231 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gja5Q01231 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gja5Q01231 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gja5Q01231 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gja5Q01231 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gja5Q01231 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gja5Q01231 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gja5Q01231 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gja5Q01231 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gja5Q01231 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gja5Q01231 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gja5Q01231 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gja5Q01231 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gja5Q01231 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gja5Q01231 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gja5Q01231 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Gja5Q01231 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gja5Q01231 Dync1i2-202ENSMUST00000100028 2097 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gja5Q01231 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gja5Q01231 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gja5Q01231 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gja5Q01231 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gja5Q01231 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gja5Q01231 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gja5Q01231 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gja5Q01231 Ighv1-61-201ENSMUST00000103531 351 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gja5Q01231 Mageb17-ps-201ENSMUST00000117902 919 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Gja5Q01231 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gja5Q01231 Gm33222-201ENSMUST00000193725 654 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gja5Q01231 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Gja5Q01231 Gm44551-201ENSMUST00000208804 171 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Gja5Q01231 Cacng1-201ENSMUST00000021065 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gja5Q01231 Timm9-201ENSMUST00000021486 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gja5Q01231 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Gja5Q01231 Lcn6-201ENSMUST00000059693 1254 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gja5Q01231 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gja5Q01231 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gja5Q01231 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gja5Q01231 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gja5Q01231 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gja5Q01231 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gja5Q01231 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gja5Q01231 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gja5Q01231 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gja5Q01231 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gja5Q01231 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gja5Q01231 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gja5Q01231 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gja5Q01231 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gja5Q01231 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gja5Q01231 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gja5Q01231 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gja5Q01231 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gja5Q01231 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gja5Q01231 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gja5Q01231 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gja5Q01231 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gja5Q01231 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Gja5Q01231 Gm13408-201ENSMUST00000119822 798 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Gja5Q01231 Gm13935-201ENSMUST00000121859 798 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Gja5Q01231 Gm13010-201ENSMUST00000140495 828 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gja5Q01231 Smim5-203ENSMUST00000152171 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gja5Q01231 Gm7030-202ENSMUST00000172968 899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gja5Q01231 AC140293.1-201ENSMUST00000225626 1247 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Gja5Q01231 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gja5Q01231 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gja5Q01231 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gja5Q01231 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gja5Q01231 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gja5Q01231 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gja5Q01231 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gja5Q01231 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gja5Q01231 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gja5Q01231 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gja5Q01231 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gja5Q01231 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gja5Q01231 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gja5Q01231 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gja5Q01231 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gja5Q01231 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gja5Q01231 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gja5Q01231 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gja5Q01231 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gja5Q01231 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gja5Q01231 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gja5Q01231 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gja5Q01231 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gja5Q01231 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gja5Q01231 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gja5Q01231 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gja5Q01231 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gja5Q01231 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gja5Q01231 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gja5Q01231 Trav13-1-201ENSMUST00000103651 331 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.7 ms