Protein–RNA interactions for Protein: P97801

Smn1, Survival motor neuron protein, mousemouse

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smn1P97801 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Smn1P97801 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Smn1P97801 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Smn1P97801 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Smn1P97801 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Smn1P97801 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Smn1P97801 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Smn1P97801 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Smn1P97801 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Smn1P97801 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Smn1P97801 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Smn1P97801 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Smn1P97801 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Smn1P97801 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Smn1P97801 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Smn1P97801 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Smn1P97801 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Smn1P97801 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Smn1P97801 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Smn1P97801 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Smn1P97801 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Smn1P97801 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Smn1P97801 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Smn1P97801 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Smn1P97801 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Smn1P97801 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Smn1P97801 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Smn1P97801 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Smn1P97801 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Smn1P97801 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Smn1P97801 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Smn1P97801 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Smn1P97801 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Smn1P97801 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Smn1P97801 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Smn1P97801 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Smn1P97801 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Smn1P97801 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Smn1P97801 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Smn1P97801 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Smn1P97801 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Smn1P97801 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Smn1P97801 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Smn1P97801 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Smn1P97801 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Smn1P97801 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Smn1P97801 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Smn1P97801 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Smn1P97801 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Smn1P97801 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Smn1P97801 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Smn1P97801 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Smn1P97801 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Smn1P97801 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Smn1P97801 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Smn1P97801 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Smn1P97801 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Smn1P97801 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Smn1P97801 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Smn1P97801 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Smn1P97801 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Smn1P97801 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Smn1P97801 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Smn1P97801 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Smn1P97801 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Smn1P97801 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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Smn1P97801 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Smn1P97801 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Smn1P97801 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Smn1P97801 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Smn1P97801 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Smn1P97801 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Smn1P97801 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Smn1P97801 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Smn1P97801 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Smn1P97801 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Smn1P97801 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Smn1P97801 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Smn1P97801 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Smn1P97801 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Smn1P97801 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Smn1P97801 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Smn1P97801 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Smn1P97801 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Smn1P97801 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Smn1P97801 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Smn1P97801 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Smn1P97801 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Smn1P97801 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Smn1P97801 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Smn1P97801 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Smn1P97801 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Smn1P97801 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Smn1P97801 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Smn1P97801 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Smn1P97801 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Smn1P97801 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Smn1P97801 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Smn1P97801 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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