Protein–RNA interactions for Protein: P97496

Smarcc1, SWI/SNF complex subunit SMARCC1, mousemouse

Predictions only

Length 1,104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcc1P97496 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smarcc1P97496 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smarcc1P97496 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smarcc1P97496 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smarcc1P97496 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smarcc1P97496 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smarcc1P97496 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smarcc1P97496 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smarcc1P97496 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smarcc1P97496 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smarcc1P97496 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smarcc1P97496 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smarcc1P97496 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smarcc1P97496 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smarcc1P97496 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smarcc1P97496 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smarcc1P97496 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smarcc1P97496 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Smarcc1P97496 Pdlim2-204ENSMUST00000127836 920 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smarcc1P97496 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smarcc1P97496 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smarcc1P97496 Gm24514-201ENSMUST00000174961 285 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Smarcc1P97496 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smarcc1P97496 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smarcc1P97496 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smarcc1P97496 Atp6v1g1-201ENSMUST00000035301 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smarcc1P97496 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smarcc1P97496 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Smarcc1P97496 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Smarcc1P97496 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smarcc1P97496 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smarcc1P97496 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smarcc1P97496 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smarcc1P97496 Sun1-203ENSMUST00000100517 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smarcc1P97496 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smarcc1P97496 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smarcc1P97496 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smarcc1P97496 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smarcc1P97496 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Smarcc1P97496 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Smarcc1P97496 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smarcc1P97496 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smarcc1P97496 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smarcc1P97496 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smarcc1P97496 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smarcc1P97496 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smarcc1P97496 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smarcc1P97496 1700084C06Rik-201ENSMUST00000135674 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smarcc1P97496 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smarcc1P97496 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smarcc1P97496 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Smarcc1P97496 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smarcc1P97496 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smarcc1P97496 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smarcc1P97496 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smarcc1P97496 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Smarcc1P97496 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smarcc1P97496 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smarcc1P97496 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smarcc1P97496 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smarcc1P97496 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smarcc1P97496 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smarcc1P97496 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smarcc1P97496 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smarcc1P97496 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smarcc1P97496 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smarcc1P97496 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smarcc1P97496 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smarcc1P97496 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smarcc1P97496 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smarcc1P97496 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smarcc1P97496 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smarcc1P97496 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smarcc1P97496 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smarcc1P97496 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smarcc1P97496 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Smarcc1P97496 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smarcc1P97496 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smarcc1P97496 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Smarcc1P97496 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smarcc1P97496 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smarcc1P97496 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smarcc1P97496 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smarcc1P97496 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smarcc1P97496 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smarcc1P97496 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smarcc1P97496 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smarcc1P97496 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smarcc1P97496 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Smarcc1P97496 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Smarcc1P97496 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smarcc1P97496 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Smarcc1P97496 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Smarcc1P97496 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smarcc1P97496 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smarcc1P97496 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smarcc1P97496 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Smarcc1P97496 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Smarcc1P97496 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smarcc1P97496 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.8 ms