Protein–RNA interactions for Protein: P97350

Pkp1, Plakophilin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp1P97350 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pkp1P97350 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pkp1P97350 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pkp1P97350 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pkp1P97350 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pkp1P97350 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Pkp1P97350 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pkp1P97350 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Pkp1P97350 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Pkp1P97350 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Pkp1P97350 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pkp1P97350 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pkp1P97350 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pkp1P97350 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pkp1P97350 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pkp1P97350 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pkp1P97350 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pkp1P97350 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pkp1P97350 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pkp1P97350 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pkp1P97350 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pkp1P97350 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pkp1P97350 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pkp1P97350 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pkp1P97350 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pkp1P97350 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pkp1P97350 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pkp1P97350 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pkp1P97350 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pkp1P97350 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pkp1P97350 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pkp1P97350 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pkp1P97350 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Pkp1P97350 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Pkp1P97350 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pkp1P97350 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Pkp1P97350 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pkp1P97350 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pkp1P97350 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Pkp1P97350 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pkp1P97350 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pkp1P97350 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pkp1P97350 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pkp1P97350 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pkp1P97350 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pkp1P97350 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pkp1P97350 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pkp1P97350 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pkp1P97350 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pkp1P97350 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pkp1P97350 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Pkp1P97350 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pkp1P97350 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pkp1P97350 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pkp1P97350 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pkp1P97350 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pkp1P97350 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pkp1P97350 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pkp1P97350 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pkp1P97350 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pkp1P97350 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pkp1P97350 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pkp1P97350 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pkp1P97350 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Pkp1P97350 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pkp1P97350 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pkp1P97350 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pkp1P97350 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pkp1P97350 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pkp1P97350 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pkp1P97350 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Pkp1P97350 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pkp1P97350 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Pkp1P97350 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Pkp1P97350 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Pkp1P97350 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pkp1P97350 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pkp1P97350 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pkp1P97350 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pkp1P97350 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pkp1P97350 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pkp1P97350 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pkp1P97350 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pkp1P97350 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pkp1P97350 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pkp1P97350 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pkp1P97350 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pkp1P97350 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pkp1P97350 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pkp1P97350 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pkp1P97350 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pkp1P97350 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pkp1P97350 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pkp1P97350 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pkp1P97350 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pkp1P97350 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pkp1P97350 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pkp1P97350 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pkp1P97350 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pkp1P97350 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms