Protein–RNA interactions for Protein: P82348

Sgcg, Gamma-sarcoglycan, mousemouse

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Length 291 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgcgP82348 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SgcgP82348 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
SgcgP82348 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SgcgP82348 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SgcgP82348 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SgcgP82348 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
SgcgP82348 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SgcgP82348 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
SgcgP82348 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SgcgP82348 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SgcgP82348 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SgcgP82348 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SgcgP82348 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SgcgP82348 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SgcgP82348 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SgcgP82348 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SgcgP82348 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SgcgP82348 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SgcgP82348 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SgcgP82348 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SgcgP82348 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SgcgP82348 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SgcgP82348 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SgcgP82348 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SgcgP82348 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SgcgP82348 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SgcgP82348 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SgcgP82348 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SgcgP82348 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
SgcgP82348 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SgcgP82348 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SgcgP82348 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
SgcgP82348 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SgcgP82348 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
SgcgP82348 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SgcgP82348 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
SgcgP82348 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SgcgP82348 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC13□□□□□ -0.33
SgcgP82348 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SgcgP82348 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC13□□□□□ -0.33
SgcgP82348 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SgcgP82348 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
SgcgP82348 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
SgcgP82348 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SgcgP82348 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
SgcgP82348 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SgcgP82348 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC13□□□□□ -0.33
SgcgP82348 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
SgcgP82348 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
SgcgP82348 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC13□□□□□ -0.33
SgcgP82348 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC13□□□□□ -0.33
SgcgP82348 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC13□□□□□ -0.33
SgcgP82348 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC13□□□□□ -0.33
SgcgP82348 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC13□□□□□ -0.33
SgcgP82348 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
SgcgP82348 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
SgcgP82348 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
SgcgP82348 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SgcgP82348 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
SgcgP82348 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SgcgP82348 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SgcgP82348 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SgcgP82348 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
SgcgP82348 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SgcgP82348 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SgcgP82348 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC13□□□□□ -0.33
SgcgP82348 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SgcgP82348 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SgcgP82348 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SgcgP82348 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SgcgP82348 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SgcgP82348 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SgcgP82348 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SgcgP82348 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SgcgP82348 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SgcgP82348 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SgcgP82348 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SgcgP82348 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SgcgP82348 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SgcgP82348 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SgcgP82348 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SgcgP82348 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SgcgP82348 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SgcgP82348 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SgcgP82348 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SgcgP82348 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SgcgP82348 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SgcgP82348 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SgcgP82348 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SgcgP82348 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SgcgP82348 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SgcgP82348 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SgcgP82348 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SgcgP82348 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SgcgP82348 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SgcgP82348 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
SgcgP82348 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SgcgP82348 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SgcgP82348 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
SgcgP82348 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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