Protein–RNA interactions for Protein: P70399

Tp53bp1, TP53-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,969 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tp53bp1P70399 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tp53bp1P70399 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tp53bp1P70399 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tp53bp1P70399 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tp53bp1P70399 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tp53bp1P70399 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tp53bp1P70399 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Tp53bp1P70399 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Tp53bp1P70399 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Tp53bp1P70399 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
Tp53bp1P70399 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
Tp53bp1P70399 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Tp53bp1P70399 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
Tp53bp1P70399 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
Tp53bp1P70399 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
Tp53bp1P70399 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
Tp53bp1P70399 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Tp53bp1P70399 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Tp53bp1P70399 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Tp53bp1P70399 Gm8385-201ENSMUST00000058999 643 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
Tp53bp1P70399 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Tp53bp1P70399 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Tp53bp1P70399 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Tp53bp1P70399 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
Tp53bp1P70399 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Tp53bp1P70399 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Tp53bp1P70399 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Tp53bp1P70399 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Tp53bp1P70399 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Tp53bp1P70399 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Tp53bp1P70399 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Tp53bp1P70399 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tp53bp1P70399 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tp53bp1P70399 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tp53bp1P70399 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tp53bp1P70399 Prr15l-203ENSMUST00000107633 930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tp53bp1P70399 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tp53bp1P70399 Gm7857-201ENSMUST00000117957 358 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Tp53bp1P70399 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Tp53bp1P70399 Gm42791-202ENSMUST00000147473 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tp53bp1P70399 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tp53bp1P70399 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tp53bp1P70399 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Tp53bp1P70399 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tp53bp1P70399 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tp53bp1P70399 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tp53bp1P70399 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tp53bp1P70399 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tp53bp1P70399 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tp53bp1P70399 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tp53bp1P70399 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tp53bp1P70399 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tp53bp1P70399 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tp53bp1P70399 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tp53bp1P70399 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Tp53bp1P70399 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tp53bp1P70399 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tp53bp1P70399 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tp53bp1P70399 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tp53bp1P70399 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tp53bp1P70399 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tp53bp1P70399 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tp53bp1P70399 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tp53bp1P70399 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tp53bp1P70399 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Tp53bp1P70399 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tp53bp1P70399 Gm33175-201ENSMUST00000211562 461 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tp53bp1P70399 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tp53bp1P70399 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tp53bp1P70399 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tp53bp1P70399 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tp53bp1P70399 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tp53bp1P70399 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Tp53bp1P70399 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tp53bp1P70399 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tp53bp1P70399 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tp53bp1P70399 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tp53bp1P70399 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tp53bp1P70399 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tp53bp1P70399 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tp53bp1P70399 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tp53bp1P70399 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tp53bp1P70399 Ighv1-52-201ENSMUST00000103522 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tp53bp1P70399 Gm23200-201ENSMUST00000104379 132 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Tp53bp1P70399 Endov-204ENSMUST00000129327 1184 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tp53bp1P70399 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tp53bp1P70399 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tp53bp1P70399 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Tp53bp1P70399 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tp53bp1P70399 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Tp53bp1P70399 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tp53bp1P70399 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Tp53bp1P70399 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tp53bp1P70399 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tp53bp1P70399 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tp53bp1P70399 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tp53bp1P70399 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tp53bp1P70399 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tp53bp1P70399 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tp53bp1P70399 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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