Protein–RNA interactions for Protein: P70217

Hoxd13, Homeobox protein Hox-D13, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd13P70217 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hoxd13P70217 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hoxd13P70217 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hoxd13P70217 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hoxd13P70217 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hoxd13P70217 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hoxd13P70217 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hoxd13P70217 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hoxd13P70217 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hoxd13P70217 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hoxd13P70217 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hoxd13P70217 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hoxd13P70217 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hoxd13P70217 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hoxd13P70217 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hoxd13P70217 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hoxd13P70217 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hoxd13P70217 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Hoxd13P70217 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Hoxd13P70217 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Hoxd13P70217 Gm2383-201ENSMUST00000181461 807 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Hoxd13P70217 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Hoxd13P70217 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hoxd13P70217 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hoxd13P70217 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hoxd13P70217 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hoxd13P70217 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hoxd13P70217 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hoxd13P70217 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hoxd13P70217 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hoxd13P70217 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hoxd13P70217 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hoxd13P70217 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hoxd13P70217 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hoxd13P70217 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hoxd13P70217 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hoxd13P70217 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hoxd13P70217 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hoxd13P70217 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hoxd13P70217 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxd13P70217 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxd13P70217 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxd13P70217 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxd13P70217 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxd13P70217 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxd13P70217 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxd13P70217 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxd13P70217 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxd13P70217 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxd13P70217 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxd13P70217 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxd13P70217 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxd13P70217 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxd13P70217 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxd13P70217 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxd13P70217 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxd13P70217 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxd13P70217 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxd13P70217 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxd13P70217 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxd13P70217 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxd13P70217 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxd13P70217 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxd13P70217 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxd13P70217 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxd13P70217 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxd13P70217 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxd13P70217 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxd13P70217 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxd13P70217 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxd13P70217 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxd13P70217 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxd13P70217 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxd13P70217 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxd13P70217 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxd13P70217 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxd13P70217 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxd13P70217 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxd13P70217 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxd13P70217 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxd13P70217 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxd13P70217 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxd13P70217 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxd13P70217 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxd13P70217 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxd13P70217 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Hoxd13P70217 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Hoxd13P70217 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Hoxd13P70217 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Hoxd13P70217 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Hoxd13P70217 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxd13P70217 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxd13P70217 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxd13P70217 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxd13P70217 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxd13P70217 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxd13P70217 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxd13P70217 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxd13P70217 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxd13P70217 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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