Protein–RNA interactions for Protein: P63154

Crnkl1, Crooked neck-like protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 690 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crnkl1P63154 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Crnkl1P63154 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Crnkl1P63154 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Crnkl1P63154 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Crnkl1P63154 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Crnkl1P63154 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Crnkl1P63154 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Crnkl1P63154 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Crnkl1P63154 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Crnkl1P63154 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Crnkl1P63154 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Crnkl1P63154 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Crnkl1P63154 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Crnkl1P63154 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Crnkl1P63154 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Crnkl1P63154 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Crnkl1P63154 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Crnkl1P63154 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Crnkl1P63154 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Crnkl1P63154 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Crnkl1P63154 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Crnkl1P63154 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Crnkl1P63154 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Crnkl1P63154 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Crnkl1P63154 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Crnkl1P63154 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Crnkl1P63154 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Crnkl1P63154 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Crnkl1P63154 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Crnkl1P63154 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Crnkl1P63154 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Crnkl1P63154 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Crnkl1P63154 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Crnkl1P63154 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Crnkl1P63154 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Crnkl1P63154 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Crnkl1P63154 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Crnkl1P63154 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Crnkl1P63154 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Crnkl1P63154 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Crnkl1P63154 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Crnkl1P63154 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Crnkl1P63154 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Crnkl1P63154 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Crnkl1P63154 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Crnkl1P63154 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Crnkl1P63154 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Crnkl1P63154 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Crnkl1P63154 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Crnkl1P63154 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Crnkl1P63154 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Crnkl1P63154 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Crnkl1P63154 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Crnkl1P63154 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Crnkl1P63154 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Crnkl1P63154 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Crnkl1P63154 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Crnkl1P63154 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Crnkl1P63154 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Crnkl1P63154 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Crnkl1P63154 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Crnkl1P63154 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Crnkl1P63154 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Crnkl1P63154 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Crnkl1P63154 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Crnkl1P63154 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Crnkl1P63154 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Crnkl1P63154 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Crnkl1P63154 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Crnkl1P63154 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Crnkl1P63154 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Crnkl1P63154 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Crnkl1P63154 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Crnkl1P63154 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Crnkl1P63154 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Crnkl1P63154 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Crnkl1P63154 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Crnkl1P63154 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Crnkl1P63154 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Crnkl1P63154 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Crnkl1P63154 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Crnkl1P63154 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Crnkl1P63154 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Crnkl1P63154 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Crnkl1P63154 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Crnkl1P63154 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Crnkl1P63154 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Crnkl1P63154 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Crnkl1P63154 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Crnkl1P63154 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Crnkl1P63154 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Crnkl1P63154 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Crnkl1P63154 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Crnkl1P63154 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Crnkl1P63154 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Crnkl1P63154 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Crnkl1P63154 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Crnkl1P63154 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Crnkl1P63154 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Crnkl1P63154 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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