Protein–RNA interactions for Protein: P62908

Rps3, 40S ribosomal protein S3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps3P62908 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rps3P62908 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rps3P62908 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rps3P62908 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rps3P62908 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rps3P62908 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rps3P62908 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rps3P62908 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rps3P62908 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rps3P62908 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rps3P62908 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rps3P62908 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Rps3P62908 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rps3P62908 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rps3P62908 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Rps3P62908 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rps3P62908 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rps3P62908 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rps3P62908 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rps3P62908 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rps3P62908 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rps3P62908 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rps3P62908 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rps3P62908 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rps3P62908 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rps3P62908 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rps3P62908 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rps3P62908 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rps3P62908 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Rps3P62908 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rps3P62908 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rps3P62908 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rps3P62908 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rps3P62908 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Rps3P62908 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rps3P62908 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Rps3P62908 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rps3P62908 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rps3P62908 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rps3P62908 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rps3P62908 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rps3P62908 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rps3P62908 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rps3P62908 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rps3P62908 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rps3P62908 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Rps3P62908 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rps3P62908 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rps3P62908 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rps3P62908 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rps3P62908 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rps3P62908 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Rps3P62908 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rps3P62908 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rps3P62908 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rps3P62908 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rps3P62908 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rps3P62908 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rps3P62908 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rps3P62908 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rps3P62908 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rps3P62908 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rps3P62908 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rps3P62908 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rps3P62908 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rps3P62908 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rps3P62908 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rps3P62908 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rps3P62908 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rps3P62908 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Rps3P62908 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Rps3P62908 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rps3P62908 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rps3P62908 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rps3P62908 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rps3P62908 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rps3P62908 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Rps3P62908 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rps3P62908 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rps3P62908 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rps3P62908 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rps3P62908 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rps3P62908 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rps3P62908 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rps3P62908 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rps3P62908 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rps3P62908 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rps3P62908 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rps3P62908 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rps3P62908 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rps3P62908 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rps3P62908 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rps3P62908 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rps3P62908 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rps3P62908 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rps3P62908 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC13.08□□□□□ -0.31
Rps3P62908 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Rps3P62908 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Rps3P62908 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Rps3P62908 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 91 ms