Protein–RNA interactions for Protein: P61407

Tdrd6, Tudor domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 2,134 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd6P61407 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Tdrd6P61407 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tdrd6P61407 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tdrd6P61407 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tdrd6P61407 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tdrd6P61407 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tdrd6P61407 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tdrd6P61407 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tdrd6P61407 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Tdrd6P61407 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tdrd6P61407 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tdrd6P61407 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tdrd6P61407 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tdrd6P61407 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tdrd6P61407 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Tdrd6P61407 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tdrd6P61407 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Tdrd6P61407 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Tdrd6P61407 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Tdrd6P61407 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Tdrd6P61407 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Tdrd6P61407 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tdrd6P61407 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tdrd6P61407 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tdrd6P61407 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tdrd6P61407 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tdrd6P61407 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tdrd6P61407 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tdrd6P61407 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tdrd6P61407 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tdrd6P61407 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tdrd6P61407 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tdrd6P61407 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tdrd6P61407 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tdrd6P61407 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tdrd6P61407 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
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Tdrd6P61407 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tdrd6P61407 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tdrd6P61407 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tdrd6P61407 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tdrd6P61407 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tdrd6P61407 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tdrd6P61407 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tdrd6P61407 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tdrd6P61407 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Tdrd6P61407 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tdrd6P61407 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Tdrd6P61407 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tdrd6P61407 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Tdrd6P61407 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tdrd6P61407 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Tdrd6P61407 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tdrd6P61407 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Tdrd6P61407 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tdrd6P61407 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Tdrd6P61407 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tdrd6P61407 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tdrd6P61407 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tdrd6P61407 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Tdrd6P61407 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tdrd6P61407 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tdrd6P61407 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tdrd6P61407 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tdrd6P61407 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tdrd6P61407 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tdrd6P61407 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tdrd6P61407 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tdrd6P61407 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tdrd6P61407 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tdrd6P61407 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tdrd6P61407 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tdrd6P61407 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.9 ms