Protein–RNA interactions for Protein: P61092

Siah1a, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH1A, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah1aP61092 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Siah1aP61092 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Siah1aP61092 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Siah1aP61092 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Siah1aP61092 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Siah1aP61092 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Siah1aP61092 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Siah1aP61092 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Siah1aP61092 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Siah1aP61092 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Siah1aP61092 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Siah1aP61092 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Siah1aP61092 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Siah1aP61092 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Siah1aP61092 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Siah1aP61092 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Siah1aP61092 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Siah1aP61092 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Siah1aP61092 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Siah1aP61092 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Siah1aP61092 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Siah1aP61092 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Siah1aP61092 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Siah1aP61092 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Siah1aP61092 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Siah1aP61092 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Siah1aP61092 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Siah1aP61092 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Siah1aP61092 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Siah1aP61092 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Siah1aP61092 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Siah1aP61092 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Siah1aP61092 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Siah1aP61092 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Siah1aP61092 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Siah1aP61092 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Siah1aP61092 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Siah1aP61092 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Siah1aP61092 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Siah1aP61092 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Siah1aP61092 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Siah1aP61092 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Siah1aP61092 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Siah1aP61092 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Siah1aP61092 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Siah1aP61092 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Siah1aP61092 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Siah1aP61092 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Siah1aP61092 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Siah1aP61092 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Siah1aP61092 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Siah1aP61092 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Siah1aP61092 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Siah1aP61092 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Siah1aP61092 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Siah1aP61092 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Siah1aP61092 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Siah1aP61092 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Siah1aP61092 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Siah1aP61092 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Siah1aP61092 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Siah1aP61092 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Siah1aP61092 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Siah1aP61092 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Siah1aP61092 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Siah1aP61092 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Siah1aP61092 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Siah1aP61092 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Siah1aP61092 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Siah1aP61092 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Siah1aP61092 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Siah1aP61092 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Siah1aP61092 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Siah1aP61092 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Siah1aP61092 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Siah1aP61092 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Siah1aP61092 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Siah1aP61092 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Siah1aP61092 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Siah1aP61092 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Siah1aP61092 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Siah1aP61092 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Siah1aP61092 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Siah1aP61092 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Siah1aP61092 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Siah1aP61092 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Siah1aP61092 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Siah1aP61092 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Siah1aP61092 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Siah1aP61092 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Siah1aP61092 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Siah1aP61092 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Siah1aP61092 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Siah1aP61092 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Siah1aP61092 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Siah1aP61092 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Siah1aP61092 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Siah1aP61092 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Siah1aP61092 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Siah1aP61092 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms