Protein–RNA interactions for Protein: P58873

Rhbdl3, Rhomboid-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhbdl3P58873 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rhbdl3P58873 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rhbdl3P58873 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rhbdl3P58873 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rhbdl3P58873 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rhbdl3P58873 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rhbdl3P58873 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rhbdl3P58873 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rhbdl3P58873 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Rhbdl3P58873 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rhbdl3P58873 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rhbdl3P58873 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rhbdl3P58873 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rhbdl3P58873 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rhbdl3P58873 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Rhbdl3P58873 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rhbdl3P58873 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Rhbdl3P58873 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rhbdl3P58873 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Rhbdl3P58873 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Rhbdl3P58873 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rhbdl3P58873 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rhbdl3P58873 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rhbdl3P58873 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rhbdl3P58873 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rhbdl3P58873 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rhbdl3P58873 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rhbdl3P58873 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rhbdl3P58873 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rhbdl3P58873 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rhbdl3P58873 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rhbdl3P58873 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rhbdl3P58873 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rhbdl3P58873 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rhbdl3P58873 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rhbdl3P58873 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rhbdl3P58873 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rhbdl3P58873 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rhbdl3P58873 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rhbdl3P58873 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rhbdl3P58873 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rhbdl3P58873 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rhbdl3P58873 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rhbdl3P58873 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rhbdl3P58873 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rhbdl3P58873 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rhbdl3P58873 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rhbdl3P58873 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Rhbdl3P58873 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rhbdl3P58873 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rhbdl3P58873 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rhbdl3P58873 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Rhbdl3P58873 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rhbdl3P58873 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rhbdl3P58873 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rhbdl3P58873 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rhbdl3P58873 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rhbdl3P58873 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rhbdl3P58873 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Rhbdl3P58873 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rhbdl3P58873 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rhbdl3P58873 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rhbdl3P58873 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rhbdl3P58873 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rhbdl3P58873 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rhbdl3P58873 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rhbdl3P58873 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rhbdl3P58873 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rhbdl3P58873 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rhbdl3P58873 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rhbdl3P58873 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rhbdl3P58873 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rhbdl3P58873 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rhbdl3P58873 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rhbdl3P58873 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Rhbdl3P58873 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rhbdl3P58873 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rhbdl3P58873 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Rhbdl3P58873 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Rhbdl3P58873 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rhbdl3P58873 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rhbdl3P58873 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rhbdl3P58873 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rhbdl3P58873 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rhbdl3P58873 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rhbdl3P58873 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rhbdl3P58873 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rhbdl3P58873 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rhbdl3P58873 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rhbdl3P58873 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rhbdl3P58873 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rhbdl3P58873 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rhbdl3P58873 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rhbdl3P58873 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rhbdl3P58873 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rhbdl3P58873 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rhbdl3P58873 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rhbdl3P58873 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rhbdl3P58873 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rhbdl3P58873 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms