Protein–RNA interactions for Protein: P57784

Snrpa1, U2 small nuclear ribonucleoprotein A', mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpa1P57784 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snrpa1P57784 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snrpa1P57784 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snrpa1P57784 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snrpa1P57784 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snrpa1P57784 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snrpa1P57784 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snrpa1P57784 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snrpa1P57784 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snrpa1P57784 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snrpa1P57784 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snrpa1P57784 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snrpa1P57784 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snrpa1P57784 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snrpa1P57784 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snrpa1P57784 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snrpa1P57784 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snrpa1P57784 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snrpa1P57784 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snrpa1P57784 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snrpa1P57784 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snrpa1P57784 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snrpa1P57784 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snrpa1P57784 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snrpa1P57784 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Snrpa1P57784 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snrpa1P57784 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snrpa1P57784 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snrpa1P57784 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Snrpa1P57784 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snrpa1P57784 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snrpa1P57784 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Snrpa1P57784 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snrpa1P57784 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snrpa1P57784 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snrpa1P57784 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snrpa1P57784 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snrpa1P57784 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snrpa1P57784 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snrpa1P57784 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snrpa1P57784 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snrpa1P57784 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snrpa1P57784 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snrpa1P57784 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snrpa1P57784 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snrpa1P57784 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snrpa1P57784 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snrpa1P57784 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snrpa1P57784 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snrpa1P57784 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snrpa1P57784 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snrpa1P57784 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snrpa1P57784 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snrpa1P57784 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snrpa1P57784 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snrpa1P57784 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snrpa1P57784 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snrpa1P57784 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snrpa1P57784 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snrpa1P57784 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snrpa1P57784 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snrpa1P57784 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Snrpa1P57784 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snrpa1P57784 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snrpa1P57784 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snrpa1P57784 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snrpa1P57784 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Snrpa1P57784 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snrpa1P57784 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snrpa1P57784 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Snrpa1P57784 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snrpa1P57784 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Snrpa1P57784 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snrpa1P57784 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snrpa1P57784 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snrpa1P57784 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snrpa1P57784 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snrpa1P57784 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snrpa1P57784 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snrpa1P57784 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snrpa1P57784 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snrpa1P57784 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snrpa1P57784 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snrpa1P57784 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snrpa1P57784 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snrpa1P57784 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snrpa1P57784 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snrpa1P57784 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snrpa1P57784 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snrpa1P57784 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snrpa1P57784 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snrpa1P57784 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snrpa1P57784 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snrpa1P57784 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snrpa1P57784 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snrpa1P57784 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snrpa1P57784 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snrpa1P57784 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snrpa1P57784 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snrpa1P57784 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms