Protein–RNA interactions for Protein: P50752

Tnnt2, Troponin T, cardiac muscle, mousemouse

Predictions only

Length 301 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnt2P50752 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnnt2P50752 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnnt2P50752 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnnt2P50752 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnnt2P50752 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnnt2P50752 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnnt2P50752 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnnt2P50752 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnnt2P50752 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnnt2P50752 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnnt2P50752 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnnt2P50752 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnnt2P50752 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnnt2P50752 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnnt2P50752 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnnt2P50752 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnnt2P50752 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnnt2P50752 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnnt2P50752 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnnt2P50752 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnnt2P50752 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnnt2P50752 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnnt2P50752 Nexmif-202ENSMUST00000087879 10891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnnt2P50752 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnnt2P50752 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnnt2P50752 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnnt2P50752 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnnt2P50752 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnnt2P50752 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnnt2P50752 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnnt2P50752 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnnt2P50752 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnnt2P50752 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnnt2P50752 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnnt2P50752 Slc44a1-204ENSMUST00000107647 2176 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnnt2P50752 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnnt2P50752 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnnt2P50752 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnnt2P50752 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnnt2P50752 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnnt2P50752 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnnt2P50752 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnnt2P50752 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnnt2P50752 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnnt2P50752 Tiparp-201ENSMUST00000047906 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnnt2P50752 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnnt2P50752 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnnt2P50752 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnnt2P50752 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnnt2P50752 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnnt2P50752 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnnt2P50752 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnnt2P50752 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnnt2P50752 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnnt2P50752 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnnt2P50752 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnnt2P50752 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnnt2P50752 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnnt2P50752 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnnt2P50752 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnnt2P50752 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnnt2P50752 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnnt2P50752 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnnt2P50752 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnnt2P50752 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnnt2P50752 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnnt2P50752 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnnt2P50752 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnnt2P50752 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnnt2P50752 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnnt2P50752 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnnt2P50752 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnnt2P50752 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnnt2P50752 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnnt2P50752 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnnt2P50752 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnnt2P50752 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnnt2P50752 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnnt2P50752 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnnt2P50752 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnnt2P50752 Setx-201ENSMUST00000061578 10970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnnt2P50752 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnnt2P50752 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnnt2P50752 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnnt2P50752 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnnt2P50752 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnnt2P50752 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnnt2P50752 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnnt2P50752 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnnt2P50752 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnnt2P50752 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnnt2P50752 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnnt2P50752 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnnt2P50752 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnnt2P50752 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnnt2P50752 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnnt2P50752 Plekhg2-201ENSMUST00000094644 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnnt2P50752 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnnt2P50752 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnnt2P50752 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.7 ms