Protein–RNA interactions for Protein: P50405

Sftpb, Pulmonary surfactant-associated protein B, mousemouse

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SftpbP50405 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SftpbP50405 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SftpbP50405 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
SftpbP50405 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SftpbP50405 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SftpbP50405 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SftpbP50405 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
SftpbP50405 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SftpbP50405 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SftpbP50405 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SftpbP50405 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SftpbP50405 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SftpbP50405 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SftpbP50405 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SftpbP50405 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SftpbP50405 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SftpbP50405 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SftpbP50405 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
SftpbP50405 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SftpbP50405 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SftpbP50405 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SftpbP50405 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SftpbP50405 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SftpbP50405 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SftpbP50405 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SftpbP50405 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SftpbP50405 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SftpbP50405 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SftpbP50405 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SftpbP50405 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SftpbP50405 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SftpbP50405 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SftpbP50405 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SftpbP50405 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SftpbP50405 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SftpbP50405 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SftpbP50405 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SftpbP50405 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SftpbP50405 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SftpbP50405 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SftpbP50405 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SftpbP50405 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SftpbP50405 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SftpbP50405 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SftpbP50405 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SftpbP50405 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SftpbP50405 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SftpbP50405 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
SftpbP50405 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SftpbP50405 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SftpbP50405 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SftpbP50405 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SftpbP50405 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SftpbP50405 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SftpbP50405 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SftpbP50405 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SftpbP50405 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SftpbP50405 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SftpbP50405 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SftpbP50405 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SftpbP50405 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SftpbP50405 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SftpbP50405 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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SftpbP50405 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SftpbP50405 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SftpbP50405 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SftpbP50405 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SftpbP50405 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SftpbP50405 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SftpbP50405 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SftpbP50405 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SftpbP50405 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SftpbP50405 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SftpbP50405 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SftpbP50405 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SftpbP50405 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SftpbP50405 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SftpbP50405 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SftpbP50405 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SftpbP50405 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SftpbP50405 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SftpbP50405 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SftpbP50405 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SftpbP50405 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SftpbP50405 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SftpbP50405 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SftpbP50405 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SftpbP50405 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SftpbP50405 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SftpbP50405 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SftpbP50405 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SftpbP50405 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SftpbP50405 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SftpbP50405 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
SftpbP50405 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SftpbP50405 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SftpbP50405 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
SftpbP50405 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SftpbP50405 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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