Protein–RNA interactions for Protein: P50284

Ltbr, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 3, mousemouse

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtbrP50284 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LtbrP50284 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LtbrP50284 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LtbrP50284 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LtbrP50284 Ica1-202ENSMUST00000115518 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LtbrP50284 Gm11628-201ENSMUST00000117568 171 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
LtbrP50284 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LtbrP50284 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LtbrP50284 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LtbrP50284 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
LtbrP50284 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
LtbrP50284 1700112L15Rik-201ENSMUST00000212067 510 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
LtbrP50284 AC124742.1-201ENSMUST00000219909 547 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LtbrP50284 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
LtbrP50284 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LtbrP50284 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LtbrP50284 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
LtbrP50284 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LtbrP50284 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LtbrP50284 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LtbrP50284 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LtbrP50284 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LtbrP50284 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LtbrP50284 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LtbrP50284 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LtbrP50284 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LtbrP50284 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LtbrP50284 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LtbrP50284 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LtbrP50284 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LtbrP50284 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LtbrP50284 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LtbrP50284 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LtbrP50284 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LtbrP50284 Gm7857-201ENSMUST00000117957 358 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
LtbrP50284 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LtbrP50284 Gm13587-201ENSMUST00000152645 366 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LtbrP50284 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
LtbrP50284 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LtbrP50284 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LtbrP50284 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LtbrP50284 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
LtbrP50284 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LtbrP50284 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LtbrP50284 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LtbrP50284 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LtbrP50284 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LtbrP50284 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LtbrP50284 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LtbrP50284 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LtbrP50284 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LtbrP50284 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LtbrP50284 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LtbrP50284 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LtbrP50284 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LtbrP50284 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LtbrP50284 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LtbrP50284 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LtbrP50284 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LtbrP50284 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LtbrP50284 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
LtbrP50284 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LtbrP50284 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LtbrP50284 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LtbrP50284 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LtbrP50284 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LtbrP50284 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LtbrP50284 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
LtbrP50284 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
LtbrP50284 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LtbrP50284 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LtbrP50284 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LtbrP50284 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LtbrP50284 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LtbrP50284 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LtbrP50284 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LtbrP50284 Pmp22-203ENSMUST00000108701 723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LtbrP50284 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LtbrP50284 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LtbrP50284 Gm15626-201ENSMUST00000117478 868 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
LtbrP50284 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
LtbrP50284 Gsto2-202ENSMUST00000120645 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LtbrP50284 Olfr647-ps1-201ENSMUST00000121599 960 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
LtbrP50284 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
LtbrP50284 Mir124-2hg-207ENSMUST00000189868 535 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LtbrP50284 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LtbrP50284 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LtbrP50284 Gm18556-201ENSMUST00000219748 1031 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
LtbrP50284 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
LtbrP50284 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
LtbrP50284 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LtbrP50284 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LtbrP50284 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LtbrP50284 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LtbrP50284 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LtbrP50284 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
LtbrP50284 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
LtbrP50284 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LtbrP50284 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LtbrP50284 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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