Protein–RNA interactions for Protein: P48678

Lmna, Prelamin-A/C, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 665 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LmnaP48678 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
LmnaP48678 Gm26540-201ENSMUST00000181858 1310 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
LmnaP48678 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
LmnaP48678 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LmnaP48678 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
LmnaP48678 4933405E24Rik-201ENSMUST00000131019 1078 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LmnaP48678 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LmnaP48678 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
LmnaP48678 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
LmnaP48678 Olfr812-202ENSMUST00000203571 1232 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
LmnaP48678 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
LmnaP48678 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
LmnaP48678 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
LmnaP48678 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LmnaP48678 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LmnaP48678 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
LmnaP48678 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LmnaP48678 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LmnaP48678 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LmnaP48678 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LmnaP48678 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LmnaP48678 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LmnaP48678 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
LmnaP48678 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LmnaP48678 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
LmnaP48678 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LmnaP48678 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LmnaP48678 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LmnaP48678 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LmnaP48678 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
LmnaP48678 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LmnaP48678 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LmnaP48678 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LmnaP48678 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
LmnaP48678 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LmnaP48678 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LmnaP48678 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
LmnaP48678 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LmnaP48678 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LmnaP48678 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
LmnaP48678 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LmnaP48678 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LmnaP48678 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
LmnaP48678 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
LmnaP48678 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LmnaP48678 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
LmnaP48678 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LmnaP48678 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
LmnaP48678 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
LmnaP48678 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LmnaP48678 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
LmnaP48678 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
LmnaP48678 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
LmnaP48678 Meig1-202ENSMUST00000115081 421 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
LmnaP48678 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
LmnaP48678 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
LmnaP48678 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LmnaP48678 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LmnaP48678 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LmnaP48678 Vmn1r-ps10-201ENSMUST00000176165 889 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
LmnaP48678 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
LmnaP48678 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
LmnaP48678 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
LmnaP48678 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
LmnaP48678 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
LmnaP48678 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
LmnaP48678 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
LmnaP48678 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LmnaP48678 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
LmnaP48678 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LmnaP48678 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LmnaP48678 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LmnaP48678 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LmnaP48678 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
LmnaP48678 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LmnaP48678 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LmnaP48678 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LmnaP48678 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LmnaP48678 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
LmnaP48678 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LmnaP48678 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LmnaP48678 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LmnaP48678 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LmnaP48678 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LmnaP48678 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LmnaP48678 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
LmnaP48678 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
LmnaP48678 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
LmnaP48678 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
LmnaP48678 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
LmnaP48678 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
LmnaP48678 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
LmnaP48678 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
LmnaP48678 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
LmnaP48678 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
LmnaP48678 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
LmnaP48678 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
LmnaP48678 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
LmnaP48678 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
LmnaP48678 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms