Protein–RNA interactions for Protein: P47758

Srprb, Signal recognition particle receptor subunit beta, mousemouse

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Length 269 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrprbP47758 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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SrprbP47758 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SrprbP47758 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SrprbP47758 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SrprbP47758 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SrprbP47758 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SrprbP47758 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SrprbP47758 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SrprbP47758 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SrprbP47758 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SrprbP47758 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SrprbP47758 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SrprbP47758 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SrprbP47758 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SrprbP47758 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SrprbP47758 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SrprbP47758 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SrprbP47758 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SrprbP47758 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SrprbP47758 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SrprbP47758 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SrprbP47758 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SrprbP47758 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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SrprbP47758 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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SrprbP47758 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SrprbP47758 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SrprbP47758 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SrprbP47758 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SrprbP47758 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SrprbP47758 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SrprbP47758 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SrprbP47758 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SrprbP47758 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SrprbP47758 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SrprbP47758 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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SrprbP47758 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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SrprbP47758 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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SrprbP47758 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SrprbP47758 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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SrprbP47758 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SrprbP47758 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SrprbP47758 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SrprbP47758 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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SrprbP47758 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SrprbP47758 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SrprbP47758 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SrprbP47758 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SrprbP47758 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SrprbP47758 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SrprbP47758 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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SrprbP47758 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SrprbP47758 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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SrprbP47758 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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SrprbP47758 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SrprbP47758 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SrprbP47758 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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SrprbP47758 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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SrprbP47758 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SrprbP47758 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SrprbP47758 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SrprbP47758 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SrprbP47758 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SrprbP47758 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SrprbP47758 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SrprbP47758 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SrprbP47758 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SrprbP47758 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SrprbP47758 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SrprbP47758 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SrprbP47758 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SrprbP47758 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SrprbP47758 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SrprbP47758 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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